SRK基因家族鉴定及其在自交不亲和沙田柚中的表达分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gaolch003
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
芸香科柑橘属类植物中沙田柚等具有典型自交不亲和特性,然而关于其自交不亲和分子机理至今未知,决定其自交不亲和特性的关键决定因子仍未克隆。实验证实SRK(S locus receptor kinase)基因是十字花科五个种引起自交不亲和反应的雌蕊决定因子。前期研究表明沙田柚(Citrus grandis Osbeck)中含有SRK同源基因,可能在沙田柚自交不亲和中起关键作用。由于沙田柚基因组序列至今未公开,本研究基于甜橙(Citrus sisensis Osbeck)全基因组信息为参考,开展全基因组水平SRK家族成员鉴定,序列结构分析,组织表达分析。主要研究结果如下:(1)以Cs SRK基因保守结构域进行Blast,筛选后得到定位在甜橙9条染色体上的113个家族基因,预测其亚细胞定位,发现61个基因位于质膜,36个基因位于线粒体,9个基因位于细胞质,6个基因位于细胞核;(2)同源性分析发现Cs SRK13与At1g07650.1、At5g39390.1具有较高同源性,且At1g07650.1、At5g39390.1基因在拟南芥中花蕾期特异高表达;(3)启动子顺式作用元件预测发现,94个基因与生长发育相关,57个基因与茉莉酸反应相关,35个基因与水杨酸反应相关,27个基因与赤霉素相关,31个基因与脱落酸相关,15个基因与乙烯相关,8个基因与胚乳、种子等的形成相关;(4)以沙田柚花器官各组织为模板c DNA,Actin为内参的半定量分析,发现Cs SRK1、Cs SRK85在花药内特异表达,Cs SRK96、Cs SRK96基因在子房特异表达,Cs SRK105在叶特异表达,而Cs SRK13在多组织内均有表达,只是表达量有差异;设置Actin与GAPDH双内参的实时荧光定量分析发现有5个基因花瓣特异表达,3个基因花丝特异表达,1个基因花柄特异表达,22个基因花药特异表达,2个基因花柱特异表达,2个基因子房特异表达;(5)锦橙五个发育时期果肉为模板c DNA,定量分析时发现Cs SRK3、Cs SRK20、Cs SRK40随着果实成熟表达量在210DAF(days after flower)时达到最高值,Cs SRK53、Cs SRK54、Cs SRK58、Cs SRK73、Cs SRK94随着果实成熟表达量越来越低,在240DAF时达到最低值;(6)利用双酶切的方法将Cs SRK13基因与PGEX-6P-1构建重组表达载体,用1.0m M/L的IPTG诱导6h后,可以很好的表达目的蛋白,该蛋白与GST标签连接,大约72k Da;预测该蛋白为跨膜蛋白,存在蛋白激酶结构域、丝氨酸/组氨酸蛋白激酶活性位点,且序列内有3种磷酸化位点,可编码8种13个激酶,以PKA、PKC为主。
其他文献
从72个随机引物中筛选出了18个引物在13个不同的种和类型的葛资源中具有RAPD多态性。扩增出的片段分子量在0.3~3kb之间,条带数在1~16条之间,共扩增出171个标记,样品间相同的标记有
苹果属()系蔷薇科()苹果亚科()植物.全世界约35种,主要分布于北温带,包括亚洲、欧洲和北美洲.中国是世界苹果属植物最大的起源中心,拥有世界苹果属资源24种,种的多型性十分丰
The interactions of a colored dynamical network play a great role in its dynamical behaviour and are denoted by outer and inner coupling matrices. In this paper