喉鳞状细胞癌患者血浆microRNA表达谱的建立和分析

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目的:利用miRNA芯片分析喉鳞状细胞癌(squamous carcinoma of larynx)患者血循环microRNA的表达情况,初步建立喉鳞状细胞癌循环microRNA表达谱,并通过相应的靶基因预测软件预测其特征性差异表达miRNA相应的靶基因,为研究喉鳞癌发生的生物分子学机制提供参考。方法:实验组共收集2012年4月到2013年1月期间喉鳞状细胞癌20例.其中14例接受不同范围的喉部分切除术,4例接受喉全切术,2例行电子喉镜下病变组织活检。所有患者均行电子喉镜检查并于镜下取活检经病理检查证实为喉鳞状细胞癌。根据肿瘤的生长部位及侵犯程度,按国际抗癌协会(UICC) TNM分类标准(2002):T,期2例,T2期6例。T3期8例,T4期4例。对照组20例均为门诊体检健康人群。所有对照组均排除了喉部疾病和其他部位肿瘤。实验组和对照组患者均于入院后第二天清晨空腹抽血,血液标本收集后在超净工作台中进行以下操作,低温高速离心机离心后吸取上层血浆转移至无酶EP管中,放置在-80℃冰箱保存备用。挑选实验组和对照组的血浆样本各4例,分别提取实验组和对照组RNA。标本质检合格后使用基因芯片分别检测喉鳞状细胞癌组和健康志愿者组血浆microRNA谱,分析芯片数据,并进一步统计分析。对比分析两者之间microRNA表达的差异,并使用相关数据库对其可能的靶基因进行预测。结果:对4例喉鳞状细胞癌和4例健康志愿者血浆进行了microRNA芯片分析。筛选出6个差异表达microRNAs,其中3个在喉鳞状细胞癌组中表达明显上调,3个明显下调。差异表达2倍以上的miRNA共有3个,分别为miR-4687-3p、 miR-4778-5p、miR-642a-3p。结论:[1]喉鳞状细胞癌患者血浆microRNA表达较正常人群有差异性改变。[2]喉鳞状细胞癌患者血浆microRNA表达谱与健康志愿者血浆miRNA表达谱相较有明显的差异性,这些差异表达的miRNAs可能成为新的喉鳞状细胞癌血浆分子生物学标志物,初步建立了喉鳞状细胞癌的循环microRNA表达谱。[3]生物信息学软件预测特征性差异表达的miRNA可能的靶基因,为进一步研究喉鳞状细胞癌发生发展的分子生物学机制提供参考。
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