目的:应用亚细胞蛋白质组学相关技术,研究大鼠部分肝切除术后72h、肝再生过程中肝窦内皮细胞膜蛋白的差异表达,为后续深入研究不同体积肝切除对肝再生的影响及控制肝再生的进程奠定基础。方法:12只雄性SD大鼠随机分为部分肝切除术组和假手术对照组(每组各6只);采用阳离子硅珠亲和纯化法分别获取两组大鼠术后72h的肝窦内皮细胞膜,并留取纯化过程中的相关肝组织样品送电镜观察;应用1DE SDS-PAGE技术分离各组肝组织样品中的蛋白质,观察比较其差异表达,并选取其中部分差异表达的条带进行串联质谱分析鉴定,然后进行相关生物信息学查询。结果:我们成功建立了大鼠的部分肝切除模型,所有大鼠均存活;电镜证实阳离子硅珠特异地结合了肝窦内皮细胞膜,而在肝组织其它结构内没有发现阳离子硅珠;经两次离心纯化后的膜样本终产物的透射电镜可见阳离子硅珠非常密集,而在其它的肝脏组织亚细胞器没有见到;运用1DE SDS-PAGE技术得到各组蛋白质样品的电泳条带图,可见各组肝组织样品的蛋白质表达有差异,选取其中差异较明显的24个条带,相应鉴定了17个差异表达的蛋白质,其中假手术组和部分肝切除术组分别为9、8个蛋白质。结论:通过建立大鼠部分肝切除模型,获取其肝窦内皮细胞膜、进行亚细胞蛋白质组学研究,我们不仅证实了大鼠部分肝切除术后72h、肝再生过程中的肝窦内皮细胞膜蛋白与假手术对照组存在差异表达,而且鉴定了相应的差异表达蛋白质,积累了肝窦内皮细胞膜蛋白亚细胞蛋白质组学的参考数据,为将来深入研究不同的肝脏切除体积对肝再生的影响及控制肝再生的进程奠定了基础。