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吉氏木蓝(Indigofera Kirilowii Maxim.ex Palibin)是山东省的一个重要乡土树种,适宜荒山及城市绿化,并具有重要的药用价值,发展前景广阔。目前,针对于吉氏木蓝的研究重要集中在其引种繁育和药理活性方面,而对于吉氏木蓝分子水平遗传多样性的研究及核心种质的研究还未见报道。本研究以山东省吉氏木蓝为研究对象,利用AFLP标记技术对其进行遗传多样性、遗传结构及核心种质的分析,以期为吉氏木蓝的种质资源评价、保护和开发利用提供一定的理论参考。实验结果如下:1.吉氏木蓝的遗传多样性分析:从64对引物中筛选出8对表现清晰、多态性较好的引物组合进行选择性扩增,8对引物共扩增出1 589条带,其中1 587条为多态带,平均多态带比例为99.87%;观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性(H)、Shannon’s信息指数(I)分别为:1.9988、1.2157、0.1401、0.2346,表明吉氏木蓝遗传多样性处于一个较高的水平;220份吉氏木蓝种质中有82份种质扩增出了特异性条带,共139条,占总条带的8.75%,其中缺失带有1条;种质间相似系数介于0.1884-0.8328之间,平均值为0.5528。聚类结果中,来源济南、青岛、威海、烟台、淄博的吉氏木蓝种质聚类较为靠拢,来源临沂、日照、泰安的种质聚类较为分散;8个吉氏木蓝种群多态带比例介于43.0 5%-75.05%之间,平均多态带比例为58.25%;多态性由大到小为:泰安>烟台>临沂>威海>济南>淄博>日照>青岛。2.吉氏木蓝的遗传结构分析:吉氏木蓝群体间遗传分化系数为0.1058,表明吉氏木蓝种质中的遗传变异主要存在于群体内,基因流为4.2904;群体间遗传一致度介于0.9750-0.9932,平均遗传一致度为0.9844;遗传距离介于0.0068-0.0254,平均遗传距离为0.0158;在遗传距离为0.014处,可将其分为4组,遗传距离与地理距离之间没有相关性。3.吉氏木蓝核心种质的构建:按照30%的取样比例构建吉氏木蓝的核心种质,包含66份种质;多态带数和多态带比例保留率分别达到了93.43%、99.87%,观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性(H)、Shannon’s信息指数(I)保留率也分别为99.93%、101.23%、107.99%和108.70%;核心种质间的遗传相似系数介于0.1879-0.6427之间,平均值为0.5356,在遗传距离为0.53处,可将其分为9组;依据AFLP结果建立了吉氏木蓝核心种质DNA指纹图谱。