由柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus, CTV)引起的柑橘衰退病是严重危害柑橘产业的主要病害之一,广泛分布于世界各柑橘产区。随着我国柑橘品种结构调整,加大了柚类和甜橙品种的推广,CTV茎陷点强株系的为害日趋严重。国内外研究经验表明,在CTV强毒株和强力传媒橘蚜区域,弱毒株交叉保护(Mild Strain Cross Prorection, MSCP)是防治茎陷点型衰退病最有效的方法。由于强弱毒株中基因型的构成,与弱毒株的防治效果有关,因此掌握CTV弱毒株中不同基因型含量的变化规律将有助于深入研究MSCP防治CTV的机理。本研究基于不同基因型CTV ORF 1a的序列差异,设计了T3基因型的特异性引物T3-4F/R,通过优化,建立了T3基因型CTV分离株的实时荧光定量RT-PCR检测方法,并对该检测方法的灵敏性、重复性和可行性进行了评价。同时对CTV弱毒株CT11和CT31在甜橙中各基因型含量的时空变化进行了监测,并评价了弱毒株CT11和CT31在田间对衰退病的防治效果。主要研究成果：1.建立的T3基因型CTV实时荧光定量RT-PCR检测体系具有特异性强,只能特异性检测含有T3基因型的CTV分离株,所建立的实时荧光定量RT-PCR检测体系比常规RT-PCR灵敏100倍,标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,扩增效率为97.1%,相关性系数为0.992,组内和组间变异系数均小于2.94%,该方法扩增效率高、线性范围广、重复性好,适用于对田间样品的检测。2.运用实时荧光定量RT-PCR技术对弱毒株CT11和CT31中各基因型在甜橙中的时空分布进行了检测。结果表明,弱毒株中T30基因型CTV含量最高。CTV不同基因型的含量在植株体内存在变化,在夏梢中含量明显高于春梢和秋梢中含量。3.通过对植株枝条平均节间长度、植株枝条茎陷点情况、果实大小品质分析和T30基因型的含量测定,对田间弱毒交叉保护植株进行防效评估。结果表明,预免疫接种弱毒株CT31和CT11均有较好的保护效果,且CT31的保护效果优于CT11。平均节间长度20mm以上的枝条的植株在CT31、CT11和对照植株中的比例分别是36%、20%、16%；无茎陷点症状的植株在接种CT31、 CT11和对照植株中的比例分别是92%、64%、46%；CT31、CT11和对照植株中的大果率依次为85.7%、68.7%、32.2%。此外,T30基因型CTV含量与茎陷点症状危害程度有一定的关联性,T30基因型CTV含量越高的植株,茎陷点型症状越弱,甚至无症状。反之,T30基因型CTV含量越低的植株,茎陷点型症状越重。