目的：了解新疆喀什地区的结核耐药情况及用DiversiLab System DNA指纹分型系统(DiversiLab系统)绘制结核分枝杆菌DNA指纹图谱,分析各菌株间的同源性,为我区结核流行病学调查提供依据。方法：收集2011年12月至2012年12月新疆喀什地区初治及复治结核病患者痰液标本,用改良酸性罗氏培养基对结核分枝杆菌进行分离培养,用对硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)对菌种进行初步鉴定,采用比例法对分离菌株进行耐药性检测,用DiversiLab System DNA指纹分型系统(DiversiLab系统)绘制结核分枝杆菌DNA指纹图谱分析菌株间同源性。结果：1.共分离出371株分枝杆菌,人结核分枝杆菌314株,牛结核分枝杆菌55株,非结核分枝杆菌2株；2.371株分枝杆菌中共有119株(32.07%)对药物有耐药性。其中初治组145例,44例(30.34%)耐药；复治组226例,75例(33.18%)耐药。3.根据DiversiLab系统同源性的判断,以相似性95%为分割点,将随机抽取的50株耐药结核分枝杆菌分成27个群。初治耐药菌同源率41.18%,复治耐药菌同源率18.75%；来自喀什市的耐药菌同源率为33.33%,来自莎车县的耐药菌同源率41.18%。结论：新疆喀什地区获得性耐药仍处于较高水平,且初始耐药菌株之间,获得性耐药菌株之间,以及初始耐药菌株与获得性耐药菌株之间均有一定的同源性。