十九大报告指出,创新是引领发展的第一动力,是建设现代化经济体系的战略支撑。战略性新兴产业作为我国政府实现经济发展方式由“投资驱动”转向“创新驱动”的重要举措,其研发创新活动具有公共物品的属性,为解决战略性新兴产业研发活动中的风险性、不确定性以及知识外溢性等引发的企业R&D投入动力不足,就需要政府适时干预市场,以纠正市场失灵,促进创新资源的有效配置。政府补贴作为政府干预市场的主要方式,是战略性新兴产业萌芽期和成长期财政扶持的主要手段。因此,研究政府补贴对战略性新兴产业R&D投入的影响,有利于优化政府补贴在战略性新兴产业R&D投入的使用效率,更为正确处理政府与市场的关系提供理论借鉴。本文对技术创新理论、市场失灵理论、政府干预理论进行了梳理,分析了战略性新兴产业政府补贴和R&D投入现状以及存在的问题,选择2012~2016年336家战略性新兴产业沪深上市公司为研究样本,利用固定效应模型实证检验了政府直接补贴和政府间接补贴对战略性新兴产业R&D投入的影响,同时将企业规模、产权性质与政府直接补贴、政府间接补贴的交互项引入模型,研究企业规模和产权性质调节效应下政府补贴对战略性新兴产业R&D投入的影响,并以新能源和高端装备制造领域的企业为分样本进行了比较分析。研究结果表明,政府直接补贴和政府间接补贴对战略性新兴产业上市公司R&D投入具有显著的促进作用,但是政府间接补贴的激励效应更强;同时,政府补贴方式受企业规模和产权性质的影响其激励作用亦存在差异。结合上述分析,提出了提升政府补贴对战略性新兴产业R&D投入有效性的建议。