文章介绍了对大规模化学反应网络研究的大致历史以及得出的结论,并采用复杂网络的研究手法对E-coli细菌以及其它有机体中新陈代谢过程存在的所有化学反应进行了研究。在这些有机体的正常生命活动中存在大量的化学反应,如何揭示这些反应方程用复杂网络刻画后展示的新性质对新陈代谢网络的研究具有很大的意义。为了展开研究,文章建立了三种网络:化学反应二分有向网、化学反应单顶点无向网、化学反应单顶点有向网。化学反应二分有向网是以参与化学反应的新陈代谢物为一类顶点,反应方程式为二类顶点,在一类、二类顶点之间通过化学反应进行的方向建立有向边(如果化学反应可逆,则有向边退化为无向边),此网络一类顶点的度分布反应了新陈代谢物参加反应方程式的多少与相应的此种新陈代谢物占总数比例之间的关系,而平均最短路径表明了在原始的化学反应方程组中,由一种新陈代谢物得到另外一种新陈代谢物平均经过的反应个数。这个网络是原始化学反应方程组信息最完全的体现。通过对化学反应二分有向网网络的度分布分析表明这个网络满足出度和入度的双向幂律分布,表示化学反应二分有向网具有Scale-free的无标度性质。通过网络模拟,证实了化学反应二分有向网和大多数Scale-free网络一样具有抗攻击的性质。从化学反应二分有向网出发向单顶点网投影可以得到化学反应单顶点无向网,此类网络以新陈代谢物为顶点。通过对化学反应单顶点无向网的度分布的统计表明这个网络同样存在Scale-free的无标度性质。这是由于只有少量的新陈代谢物参与了大量的化学反应这个事实所决定的。从化学反应二分有向网出发建立化学反应单顶点有向网,此种网络表明了新陈代谢过程中物质的流向,在此网络上研究其拓扑特性,证实这也是一个满足出度和入度双向幂律分布的Scale-free网络,并且在这个网络中找到了一个物质转化的核心结构。