从20世纪90年代末以来,特别是在提出建立社会主义市场经济体制目标之后,农村的经济体制改革在不断的深化,市场机制在不断完善的同时也对农业资源的配置发挥着基础性的作用。农村合作制、股份合作制、个体、私营经济在发展多种所有制经济的基础上发展的十分迅速,从无到有,从小到大。“十二五”是我国建设社会主义新农村、提高农业生产力、转变农业增长方式、发展现代化农业非常重要的时期。特别是近几年来,国家对农机专业合作社的扶持力度在不断的加大,黑龙江省农机专业合作社也有了进一步的发展。但是,一些合作社在发展过程中仍存在着许多制约因素。在此背景下,完善农机专业合作社的科学管理机制也显得十分必要。论文通过对黑龙江省农机合作社目前发展情况进行分析研究,从公共管理理论入手,立足于黑龙江省农机专业合作社的发展和现行管理机制的实际情况,运用了文献研究法、比较分析法和实证分析法,探究了黑龙江省农机专业合作社发展的自身问题及管理方面的缺陷。如：合作社的运营机制不规范、监督机制不完善、发展动力机制不充足等。在借鉴加拿大魁北克省、澳大利亚、俄罗斯和国内湖北省、山东省的先进农机服务组织经验基础之上,着重从激励机制、保障机制、监督机制和安全管理机制等方面,提出了完善黑龙江省农机专业合作社科学管理机制的对策。