深圳市ILI和手足口病预测及干预模型的研究

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传染病是由病原体引起的能在人与人之间相互传播的一类疾病。传染病的暴发容易引起社会恐慌,造成大量的人力物力的损失。对传染病进行跟踪监控及预测是目前传染病控制与预防的重点。深圳市作为改革开放的前沿,首创向市民发布流感指数和手足口病指数预警信息。但是,目前深圳市疾病控制与预防中心发布的流感指数和手足口病风险指数还存在以下问题:指数固定每周三发布,内容只有极易发生、易发生、较易发生和较少发生4个等级,缺乏详细的统计数据;采用的样本太少,缺乏代表性;流感指数计算方式过于简单,存在较大的主观因素;缺乏应对疫情暴发的对策及措施。本文针对流感与手足口病的监控、预测和模拟进行研究,主要工作如下:(1)采集数据:从深圳市疾病预防控制中心提供的数据库获取了病例数据,新的数据表统计了全市743家医疗机构2010年到2017年的流感样病例(Influenza-like illness)及手足口病例信息,保证了数据的全面和多样。(2)建立流感和手足口病监测模块:监测模块通过地图展示了深圳市全市各区的按月统计的传染病分布情况和传染病发病人群的年龄分布特征。地图会随着时间轴的推移自动改变图形,以达到动态显示患病人数变化的效果。(3)建立传染病预测模块:运用了线性回归、决策树、随机森林、XGBoost四种回归算法进行各区的病例比例预测,并分别选出流感和手足口病的最优模型。此外还在模型中加入天气特征和空气质量特征,结果发现对预测影响不大。(4)建立流感模拟干预模块:利用深圳市出租车的GPS地理信息数据,结合深圳市各医疗机构的地理位置信息建立了 SIR传播模型。传播模型考虑了疫苗和限制人口流动的因素,并把干预的结果动态地显示在地图上。本文还对干预的效果进行比较,结果发现流感的传播以区域内传播为主,区域间的传播不明显。这说明疫苗的干预手段效果很好,但限制人口流动的干预效果却不好。
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