DNMT1和MBD1对P19细胞DNA甲基化动力学影响的研究

来源 :内蒙古医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hongchaozhang88
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研究DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferases1,DNMT1)和甲基化-Cp G-结构域结合蛋白1(Methyl-Cp G-binding Domain protein 1,MBD1)对P19中DNA甲基化的动力学的影响。方法:(1)培养P19细胞,然后将携带MBD1短发夹RNA(short hairpin RNA,sh RNA)#2号慢病毒载体和Scramble(无意义)sh RNA转染到P19细胞中,给予嘌呤霉素(puromycin)筛选出已感染的细胞;利用荧光显微镜、qPCR验证慢病毒载体对P19细胞MBD1敲减效率。(2)用MTT法检测给予不同浓度(2.5、5、10、20和40μmol/L)的5-氮杂胞苷(5-Azacytidine,5-Aza)在24h、48h、72h对P19细胞的抑制率,筛选出最佳的5-Aza浓度,并利用qPCR和Western blotting筛选出最佳的作用时间。培养5-Aza处理的P19细胞,然后利用qPCR和Western blotting检测MBD1、DNMT1、DNA甲基转移酶3a(DNA methyltransferases 3a,DNMT3a)、DNA甲基转移酶3b(DNA methyltransferases 3b,DNMT3b)以及TET(ten-eleven translocation)1,TET2,TET3 mRNA和蛋白表达水平,利用ELISA法测定细胞中5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine content,5-m C)、5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxy-methylcytosine,5-hm C)蛋白的含量。(3)培养已转染慢病毒载体的P19细胞,用qPCR和Western blotting检测MBD1、DNMT1、DNMT3a、DNMT3b以及TET1、TET2、TET3 mRNA和蛋白表达水平;ELISA法测定细胞中5-m C、5-hm C蛋白的含量;结果:(1)利用荧光显微镜观察P19细胞感染慢病毒72h后绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)的表达情况,使用嘌呤霉素筛选后sh MBD1慢病毒载体感染效率在90%以上;qPCR结果显示,Scramble组与对照组相比,无显著性差异(P>0.05),表明慢病毒本身对细胞MBD1 mRNA水平无明显影响;#2慢病毒转染组与Scramble组相比,MBD1 mRNA水平均下降,差异具有显著性(P<0.01),敲减率可达86.07%。Western blotting进一步证明#2慢病毒可使P19细胞的MBD1蛋白表达水平下降(P<0.01),其对P19细胞MBD1蛋白表达的抑制作用可达68.60%。(2)MTT法检测显示5-Aza以10、20和40μmol/L作用24h、48h和72h时,细胞抑制率增加,呈剂量依赖性;给予P19细胞10、20和40μmol/L 5-Aza,利用qPCR检测各时间点DNMT1、DNMT3a、DNMT3b和5-hm C mRNA表达水平,结果显示DNMT1除了10μmol/L作用24h之外,其它各浓度各时间点的mRNA水平均下降,且呈时间和剂量依赖性(P<0.01);当浓度为40μmol/L时,作用24h、48h和72h后DNMT3a mRNA水平均下降(P<0.01);在5-Aza剂量为10μmol/L时作用24h、48h和72h后DNMT3b mRNA水平均升高(P<0.05,P<0.01,P<0.01,各自的)、5-Aza剂量为20μmol/L、40μmol/L时各自作用48h和72h后DNMT3b mRNA水平升高(P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.01,各自的);5-hm C mRNA水平随作用时间延长(24h到72h)和浓度的增加(每个时间点下浓度分别为10μmol/L、20μmol/L和40μmol/L)逐渐上升(P<0.05,P<0.05,P<0.01,P<0.01,P<0.05,P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.01,各自的)。然后给予细胞20μmol/L 5-Aza,利用qPCR检测各个时间点MBD1、TET1、TET2、和TET3 mRNA水平,利用Western blotting检测各个时间点MBD1、DNMT1、DNMT3a、DNMT3b和TET1、TET2、TET3蛋白表达水平。qPCR结果显示在48h和72h时MBD1和TET1 mRNA水平增加(P<0.01);TET2 mRNA水平在24h、48h和72h均升高(P<0.01)。Western blotting结果显示MBD1在48h时蛋白表达水平升高(P<0.01);DNMT1在48h和72h时蛋白表达水平降低(P<0.01);DNMT3a、DNMT3b和TET3各时间段的蛋白表达水平无明显改变(P>0.05);TET1在72h时蛋白表达水平增加(P<0.05);TET2的蛋白表达水平在24h、48h、72h时均升高(P<0.05,P<0.01,P<0.01,各自的);ELISA结果显示给予不同浓度(10、20、40μmol/L)不同作用时间(24h、48h、72h)的5-Aza后,P19细胞中5-m C的表达水平与对照组相比,除24h 10μmol/L外其余均有所下降(P<0.05,P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.01,各自的),5-hm C的表达水平除24h 10μmol/L、48h 10和20μmol/L外其余组较对照组显著上升(P<0.01,P<0.01,P<0.05,P<0.01,P<0.01,P<0.01,各自的),且呈剂量和时间依赖性。(3)慢病毒转染好的P19细胞,利用qPCR和Western blotting检测DNMT1、DNMT3a、DNMT3b、TET1、TET2、TET3及5-hm C mRNA表达水平,qPCR结果显示,Scramble组与对照组相比,DNMT1、DNMT3a、DNMT3b、TET1、TET2、TET3及5-hm C mRNA水平没有明显差异;sh MBD1组与Scramble组相比,TET1 mRNA水平没有明显改变,DNMT1、DNMT3a、DNMT3b、TET2、TET3及5-hm C mRNA水平均增加(P<0.05,P<0.05,P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.05,各自的);Western blotting结果显示,Scramble组与对照组相比,DNMT1、DNMT3a、DNMT3b和TET1、TET2、TET3的蛋白表达水平没有明显差异(P>0.05);sh MBD1组与Scramble组相比,DNMT1、DNMT3a、DNMT3b及TET2、TET3蛋白表达增加(P<0.01,P<0.01,P<0.01,P<0.05,P<0.05,各自的),TET1蛋白表达水平没有明显变化(P>0.05)。ELISA结果显示MBD1敲减组5-m C的表达水平与Scramble组相比较明显下降(P<0.01),而5-hm C的表达水平较Scramble组显著升高(P<0.01),且呈剂量和时间依赖性。结论:5-Aza能有效降低DNMT1 mRNA和蛋白表达水平;#2重组MBD1 sh RNA慢病毒载体能有效降低MBD1 mRNA和蛋白表达水平;MBD1和DNMT1相互影响相互作用,共同维持DNA甲基化的动态平衡;DNMT1与TET3相互作用,而MBD1通过直接调控P19细胞TET1维持细胞内5-m C和5-hm C的动态平衡,因此DNMT1和MBD1在DNA甲基化动力学稳态维持中扮演着重要的角色。
其他文献
本文设计了一套融合RFID和气体传感网定位的信息采集系统,可实现对有毒气体浓度的检测、泄露源的精准定位和采集RFID标签信息等功能。本系统排除了人为检测的危险,并根据电子
目的:通过探讨大动脉粥样硬化型(large-artery atherosclerosis,LAA)缺血性脑卒中(ischemic Stroke,IS)及小动脉闭塞型(Small-artery occlusion,SAO)缺血性脑卒中血栓弹力图(Thromboelastography,TEG)参数(R值、K值、Angle角、MA值)之间表达的差异,以及血栓弹力图参数与凝血指标纤维蛋白原(Fibrin
计算机视觉对三维重构的精确性有较高的要求,而三维重构的精确性与摄像机内参数有着十分重要的联系.一般来说,双平面镜折反射系统由两块平面镜和一个传统摄像机组成.该成像系统能产生一个物体的多个视图,利用物体的多个视图不仅能完成摄像机标定,而且通过它们可以重构出较为精确的三维模型..因此,双平面镜折反射系统具有重要的研究价值和意义.利用双平面镜折反射系统产生一个物体的五个视图.在透视图像上取五个点,其中一
近年来互联网等技术迅猛发展,计算机视觉的研究也越来越火热。目标检测是计算机视觉的研究重点也是一个难点。在日常生活场景中,图片成像时会受到外界环境的变化以及各种干扰
随着科学技术的飞速发展和经济的快速增长,无线电通信设备不断增加,使得整体电磁环境趋于复杂化,也使有限的频谱资源日益拥挤,日渐紧张,同时,导致监测频谱资源与管理频谱资源
教会计算机学会逻辑推理是人工智能的终极目标,可视化自动问答(Visual Question Answering,VQA)是其中一个重要研究领域,它综合了计算机视觉(Computer Vision,CV)和自然语言
目的:内皮细胞相互连接形成完整的血管内壁,是维持血循环稳定的重要基础,通过复杂的机制,在维持凝血系统与纤维蛋白溶解(纤溶)系统平衡方面发挥重要的作用。组织纤溶酶原激活物(tissue plasminogen activators,t-PA)激活纤维蛋白溶解酶原(plasminogen,PLG)生成纤维蛋白溶解酶(plasmin,PL),是启动纤溶系统的关键步骤。内皮细胞表面表达annexin A2
贄見類啓文指攜禮求見尊者長(5時呈送的啓文,是宋代啓文中的一類,也是贄見禮影響下的產物。啓文發展到宋時已成為士人常用的書牘類型,並且開始在宋集部書籍中出現非常細緻的分類,贄見類啓文也正式出現在這些分類之中,贄見類啓文也因其與贄見禮儀的緊密聯繫而區別於其他啓文小類。贄見禮作為見面禮的一種,指攜帶禮物求見,最開始攜帶之物是玉帛、禽鳥等實物,唐宋則受科舉行卷、仕宦薦舉等影響興起以詩文贄見之風。詩、書、啓
中心折反射摄像机具有单一的有效视点和成像视野大等优点,因此在计算机视觉领域中显得尤为重要.本文通过分析空间球在抛物折反射摄像机下的成像特征,根据极点—极线、三正交消失点与绝对二次曲线的像的关系,提出三种新的算法标定抛物折反射摄像机.在抛物折反射摄像机下,空间球投影到单位视球上形成一对对拓小圆.这对对拓小圆相交于两对共轭虚点,由这两对共轭虚点确定过小圆圆心的对称轴和小圆所在平面的无穷远点.从而得到像
量子图像处理主要研究适合量子计算机的量子图像算法,它涉及量子力学,量子信息处理和图像处理等学科的交叉融合。近年来,量子图像表示模型及其相关的应用研究一直是图像处理