棉花是我国重要的经济作物之一。干旱是影响棉花生产的主要非生物胁迫因素，开展棉花抗旱遗传机理的研究及抗旱品种的培育，对我国棉花产业的可持续发展意义重大。本研究通过“中棉所7号×新海20”海陆杂交群体绘制了分子遗传图谱，对群体苗期株系进行抗旱性评价，并对抗旱相关性状进行QTL初步定位，以期为棉花抗旱基因的筛选及抗旱机理提供依据。取得的结果如下:　　(1)通过对F2群体的田间表型性状进行分析，结果表明:F2群体表型性状的变异程度较大，均在33.03-68.19％，田间各性状变异程度存在差异。通过对室内PEG胁迫的表型性状分析，结果表明:0％PEG6000和10.5％PEG6000条件下，各性状变异系数均在30％以上;两种处理条件下均体现了较大变异范围。田间及室内各表型性状指标偏度和峰度均小于1，符合正态分布，说明群体适合进行图谱构建。通过主成分分析将11个抗旱相关性状指标转化为5项累计贡献率达到82.53％的指标，这5类指标可以作为评价棉花苗期抗旱性的指标。其重要程度为:生物量性状＞根冠比性状＞相对生长率＞最大根长＞苗高、侧根数。抗旱性评价的结果表明:系12的抗旱性度量值(D)最小0.14，抗旱性最差;系25的抗旱性度量值(D)最大1.29，抗旱性最强。母本中棉所7号的抗旱性明显强于父本新海20。其中156个株系的抗旱度量值(D)介于两亲本之间，37个株系抗旱性度量值(D)小于父本新海20，15个株系的抗旱性度量值(D)大于母本中棉所7号。　　（2)利用578对SSR引物在亲本中棉所7号与新海20间进行了多态性引物的筛选，一共筛选出107对稳定多态性的标记，占多态性引物数的18.51％。基于分子标记排列顺序与位点比较，该连锁图谱与已报道的海陆遗传图谱有较高的一致性，可以用于QTL定位研究。结合F23家系各苗期抗旱相关性状检测结果表明，后代群体呈现微效多基因控制的数量性状遗传的特点。　　(3)利用中棉所7号和新海20建立的群体，通过107个SSR标记初步构建了一个包含33个连锁，93个标记的全长2970.23cM遗传图谱，占基因组67.5％。每两个标记间距31.93cM，每个连锁群中包含的平均标记数是2.82个，涉及的棉花的17条染色体。　　(4)采用完备区间作图法进行基因组QTL扫描，初步检测到41个QTL，其中检测到控制棉花苗期根干重3个，根鲜重4个，地上部鲜重2个，地上部干重2个，总鲜重6个，可解释变异的3.01-25.67％;检测到鲜重根冠比4个，干重根冠比4个，解释表型变异的2.24-16.70％;检测到侧根数4个，最大根长4个，可解释变异的4.37-10.87％;检测到棉花苗高5个，相对生长率3个，可解释表型变异的3.30-13.00％。