在世界水资源短缺及严重污染的背景下，山东省政府实施了“两湖一河”碧水行动，其治理重点之一是小清河流域，马踏湖位于桓台县境东北部小清河南岸，是小清河流域内的一个重要淡水湖泊。2012年，桓台县《马踏湖生态环境综合治理规划方案》拟将猪龙河和乌河恢复历史走向，使马踏湖具有足够的水面以满足马踏湖生态蓄水要求，实现马踏湖生态环境的恢复。为了给马踏湖生态修复蓄水提供水量和水质的保证，本文采用SMS(SurfaceWerter Modeling System)地表水模型系统环境仿真软件，并结合马踏湖特点，制定网格划分的总体原则，解决了马踏湖水流水质模拟结果不稳定与不收敛的关键技术问题；进行了数学模型边界输入条件的概化处理；开展了糙率、扩散系数与污染物降解系数等参数的分析研究；利用马踏湖地形数据及水文资料，建立了符合马踏湖水环境状况的水流水质模型，选取CODCr为湖泊水环境的主要水质指标，对马踏湖生态修复中心湖区和全湖区进行了水流水质的模拟计算，比较了不同条件下的水质变化，得出了以下结论：（1）基于SMS软件建立的马踏湖水流水质模型，其水力学和水质边界条件可保证模拟结果的稳定性、收敛性和合理性，在马踏湖水流水质的模拟预测中具有普遍适用性。（2）马踏湖一期工程建成的中心湖区库容较小，湖泊流场随入湖流量的变化比较敏感，当入湖流量改变时，湖泊中各个位置的流速大小和流向都有所变化。入湖流量的变化对流场影响较大，相应的对湖区浓度场的分布影响也较大。（3）马踏湖二期工程建成的全湖区，湖泊流场随入湖流量变化较小，湖区污染物分布规律随流量变化较小。（4）模拟了中心湖区不同情形下的CODCr浓度场变化，归纳出湖区平均浓度和出口浓度与入流流量和入流浓度的关系方程，并验证了结论的可靠性。（5）模拟了全湖区蓄水方案一和方案二不同情形下的CODCr浓度场变化，得出了湖区超标面积(以文献[48]中地表水环境质量标准III类为标准)、平均浓度和出口浓度与入流流量和入流浓度的关系方程，并验证了结论的可靠性，对比了全湖区蓄水方案一与方案二的允许入流污染负荷，给出了全湖区建成以后的蓄水建议。