中小企业在我国经济社会中占据重要地位,对稳定就业、促进发展有着不可替代的作用,然而作为我国社会经济的关键一环,却始终存在抗风险能力差、管理水平低等许多问题,因此多数商业银行在贷款业务中并不倾向于将资金交托给此类中小企业。中小企业想要将资金更多的用于创新投入对于企业本身而言存在许多困难。影子银行的出现正是基于这种需求,它游离于传统进入体系,且自从在我国出现后便迅速发展,在资本市场的影响力也与日剧增,并引起了广泛的探讨。在功能上,影子银行与商业银行类似,它为市场上的资金需求者带来了新的融资选择,特别是对于想要进行更多项目研发的中小企业,为其提供了一个可供融资的道路。基于此,文章首先对已有文献进行了梳理和总结,然后在阐述了影子银行我国本土化后的情况下,着重分析当前我国影子银行现状以及小微企业所面临的融资困境,以及新三板中小企业的总体创新投入状况。随后在此基础上,对三者间的相互影响作用是以怎样的传导方式进行的做出了推导,并提出了将融资约束作为门槛变量再衡量影子银行对小微企业创新投入的影响的研究假设。在实证中,本文采用了新三板1274家上市公司2013-2018年的数据,利用面板门槛回归模型进行包括全样本、行业异质性、时期异质性的回归检验,并选取了适合短面板数据的固定效应、随机效应两种线性回归进行比照,采用替换核心变量指标的方式完成稳健性检验,从而验证假设。实证结果表明,对于新三板中小企业而言,影子银行与创新投入之间存在着逐渐递减的非线性关系,且是以融资约束作为门槛的单重弯折,影子银行对于创新投入的负面影响会在超过门槛值之后显著增大,在不同时期存在不同的门槛效应,但对于不同行业,尽管同样存在影子银行对创新投入的负向影响,却未必均存在门槛效应。基于此结论和当前政策,本文对于如何使影子银行能够协助我国的主流金融体系共同服务于经济社会发展、助中小企业更好的进行企业创新提出实用性建议。