随着高等教育改革全面深入地进行,高等教育的各个方面都取得了比较明显的成绩,学校财务管理也面临着更加复杂的局面。保持良好的财务状况和一定发展潜力,是高等学校持续稳定发展的必要条件。因此,对高校财务绩效进行科学的评价,及时、准确地反馈财务信息,了解学校发展潜力,具有重要的理论与时间研究价值。本文在分析国内外高校财务绩效评价理论研究成果的基础上,阐述了高校财务绩效评价的指导思想、评价指标的内涵和建立高校财务绩效评价指标体系的原则。探索建立一个统一的、相对可比的高校财务绩效评价指标体系,运用建立的指标体系和层次分析法对教育部直属的部分高校进行了财务绩效的实证分析,分析了这些高校财务绩效各项指标的执行情况,并进行排序比较和评价,验证了该高校财务绩效评价体系的有效性。针对教育部直属的D高校进行了财务绩效评价的案例分析。通过对高校财务绩效评价指标与其他院校的指标对比,发现该高校财务绩效管理的弱点。结合该高校的实际情况针对财务绩效评价中发现的问题突出了相应的对策建议和改进措施。