项目管理是现代管理学的一个重要组成部分,拥有70多年的发展历史,是在确定的项目周期内,运用各种工具、方法、知识和技能,通过开展有效的项目计划、组织项目流程、协调项目过程与控制项目进度,充分有效的利用有限资源完成既定项目目标的过程。项目管理作为一套较为成熟的理论与方法体系,在面对复杂多变的外部环境、激烈变动的市场竞争、浩大繁复的系统工程时,能够有效起到优化资源配置、提高效率、节省成本的作用,达成项目管理目标。科研项目即具有项目的一般属性,又有其特殊性,适合用项目管理的方法提升管理水平。本文运用现代项目管理的理论和方法,结合中国科学院北京基因组研究所的存在的情况,具体分析了原来有的管理方法所存在的很多问题,建立了适合基因组所科研项目管理的项目运行模式和具体实施方法,建立了一整套规范化、操作性强的科研项目管理的流程与制度。基因组所在科研项目管理方面遇到的实际问题,在我国科研院所科研项目管理中具有较强的代表性和普遍性。对这一问题的深入研究,能够为类似科研单位的科研项目的管理工作提供一些有益的可供借鉴的经验及方法,这对于加快促进科研院所的深化管理改革、有效提升核心竞争力、用以实现又好又快发展具有重要意义。本论文首先介绍了基因组所科研项目管理存在的问题,提出了项目管理应用于基因组所科研项目管理这一课题。接着介绍了项目管理的发展,并在介绍项目管理基本理论与科研项目特点的基础上,分析了在科研项目管理中应用项目管理的可行性及意义。然后,对基因组所开展科研项目管理进行了需求分析,明确了当前在流程和制度上存在的问题。在分析现状的基础上,提出了基因组所科研项目管理的管理模式、总体实施的框架结构、以矩阵式的组织管理结构及适当有效的激励机制为重点的内容保障体系。针对原来科研项目的管理流程存在不完善的情况,建立了适用于基因组所的科研项目全生命周期管理流程,完善并规范了科研规划、立项、实施、验收及验收后等几个阶段的管理流程及管理制度。根据基因组所的实际情况,在两个阶段之间设立关键有效的控制点,一共四个控制点。在项目立项、验收评审中设立了有关科研项目评价的重要指标体系。本论文的研究成果自2012年以来在基因组所得到了实施应用,明确了“十二五”基因组所的战略定位和主攻方向,有效提升了科研项目的立项数量；提高了科研项目的完成的质量,取得了相对良好的应用效果。