专项审计调查是《中华人民共和国审计法》赋予审计机关对关系国计民生的重要经济活动和国家宏观经济运行、国家重大投资项目、惠民政策落实等情况进行调查和监督的一种重要的审计职能。专项审计调查在促进国家重大决策部署落实、促进公共资金安全高效使用、维护国家经济安全、改善民生和生态文明建设、推动深化改革、促进依法行政和推进廉政建设等方面都发挥着不可替代的重要作用。近年来,审计署和基层各级审计机关广泛开展了各类专项审计调查工作。但是由于经济社会发展日新月异,政府和公众对专项审计调查的需求也不断提高,而审计机关特别是广大基层审计机关由于理念落后、信息不对称和审计力量不足等原因,在专项审计调查的实践中面临不少的困难和问题,专项审计调查的一些理念和实践还需要进一步研究完善。本文以济南市专项审计调查工作开展情况为研究对象,通过各种途径搜集整理了济南市以及其他审计机关专项审计调查工作的大量数据与案例,并借鉴以往专项审计调查的研究成果,综合运用了文献研究、比较研究和定性与定量相结合的研究方法,系统地研究了济南市专项审计调查工作的发展历程、采取的主要措施和取得的成效。同时,从基层审计机关实际出发,结合案例具体分析了济南市专项审计调查存在的计划编制不科学、资源分配不合理、审计方法单一、审计成果运用不足、审计调查查处违法问题和揭示经济风险能力较弱、缺乏专项审计调查绩效评价体系和理论研究不足等六个方面的问题,从计划制定、绩效评价、体制机制、风险识别、成果运用和理论研究等六个环节深入分析了问题产生的原因。最后,结合济南市和其他基层审计机关正反两方面的经验,提出了建立专项审计调查高风险领域评估制度、建立专项审计调查绩效评价体系、创新专项审计调查方法、推进审计机关人财物统一管理改革、提高专项审计调查成果运用能力以及对专项审计调查进行新的准确定位等六项完善基层专项审计调查的对策建议,以期妥善解决其在专项审计调查工作中遇到的各种困难和问题,更好的发挥专项审计调查在深化改革、完善国家治理方面的积极作用。纵观我国专项审计调查的许多理论研究和实证研究成果,虽然有较强的学术价值,不过关于基层审计机关审计调查实践的研究并不多,既有的实证研究也由于时期较早和经济社会环境的巨大变化导致缺乏指导实践的意义。所以,本文最大的创新点是结合济南市专项审计调查的实际情况,从完善国家治理体系,实现审计调查现代化的角度,把专项审计调查定位为维护和增进公共利益的重要手段。同时,提出建立专项审计调查高风险领域评估制度和绩效评价体系、创新专项审计调查方法、实现省以下审计机关人财物统一管理等改革和发展的具体建议,这对基层审计机关专项审计调查工作的科学发展具有一定的参考价值与现实意义。由于作者在专项审计调查数据搜集方面面临的困难和视野的局限,本文在数据的分析方面仅能依托于既有的数据,由于缺乏全国范围的准确全面的数据,现有的分析可能存在偏颇之处,另外基于作者作为审计一线工作者而非专业审计理论研究者,本文在审计理论的分析方面也缺乏一些理论研究的深度,这些不足之处还需要今后专项审计调查的研究者予以弥补。