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水质恶化是湖泊生态系统健康的主要制约因素之一。在人类活动增强和全球气候变暖的背景下,湖泊营养物质增多所带来的一系列环境问题不断加剧,湖泊水环境受到了严重威胁。抚仙湖作为我国第二深水湖泊,湖泊面积和蓄水量分别占全国的第8位和第3位,储存了中国战略淡水资源的9%,流域水资源丰富,为滇中地区社会经济可持续发展提供了重要保障。近年来,有研究表明抚仙湖水质出现下降趋势,对湖泊生态系统健康和社会经济持续发展构成了长期的潜在危害。微生物生长周期短,能对环境变化作出快速响应,作为湖泊生态系统食物链和食物网的重要组成部分,对维持湖泊生态系统健康和稳定起着重要的作用,已成为指示水体环境和生态系统健康的常见指标。已有研究发现过去几十年抚仙湖浮游植物生物量和群落结构出现明显变化,并对浮游细菌的群落组成进行了初步研究,但缺乏对抚仙湖浮游植物结构变化的逐年调查和对浮游细菌的季节变化调查并且对浮游植物与浮游细菌之间的关系缺乏认识。本文以抚仙湖浮游植物与浮游细菌作为主要研究对象,对抚仙湖2015年1-12月、2016-2018年3、6、9、12月的浮游植物和2015年1-12月的浮游细菌进行周期性的样品采集。对抚仙湖浮游植物和浮游细菌群落结构、与环境因子的关系进行调查分析,研究浮游植物和浮游细菌群落结构的时空变化及它们之间的相互关系,识别驱动浮游植物和浮游细菌变化的环境因子,并初步探究抚仙湖浮游植物与浮游细菌之间的关系,以期为抚仙湖的生态保护提供重要的科学依据。研究结果表明:(1)抚仙湖水体中共鉴定出浮游植物6门58属,其中绿藻门的属数最多(30属),其次为蓝藻门和硅藻门(均为11属),其它门类的属数较少(甲藻门3属,隐藻门2属,金藻门1属)。与2002-2003年转板藻占据绝对优势相比,抚仙湖优势种发生明显变化。2015年和2016年的优势种为甲藻门的飞燕角甲藻、绿藻门的转板藻、硅藻门的小环藻和金藻门的锥囊藻;2017年和2018年的优势种为飞燕角甲藻、转板藻和多甲藻。研究期间,蓝藻门的束丝藻相对比例呈上升趋势。(2)2015-2018年抚仙湖浮游植物由绿藻门、甲藻门、硅藻门、金藻门、蓝藻门和隐藻门组成。绿藻门和甲藻门相对比例较高。浮游植物总生物量、蓝藻门和甲藻门生物量和相对比例在年际上均呈上升趋势,金藻门生物量呈上升趋势,但相对比例呈下降趋势。方差分析和相似性分析表明抚仙湖浮游植物生物量和群落结构在时间上有明显的变化趋势(P<0.001),在空间上的变化不显著(P>0.05)。冗余分析结果表明,水温、营养盐(总磷、总氮)和离子浓度(钾离子、钙离子、钠离子、镁离子)是驱动抚仙湖浮游植物群落结构变化的显著环境因子。方差分解结果显示,水温单独解释了浮游植物群落结构变化的8.1%,营养盐单独解释了4.5%,离子单独解释了16.8%,水温和营养盐共同解释了4.3%,营养盐和离子共同解释了0.1%,水温和离子共同解释了4.2%,水温、营养盐和离子三组环境因子共同解释了1.0%。(3)放线菌门、变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、蓝细菌门、疣微菌门、绿弯菌门和厚壁菌门是2015年抚仙湖浮游细菌的主要组成门类。放线菌门和变形菌门的比例相对较高。从方差分析和相似性分析结果可知,浮游细菌丰度和群落结构在时间上差异显著(P<0.001),但在空间上差异不显著(P>0.05),浮游细菌丰度在夏季和秋季相对较高。方差分解显示水温、总磷和浮游植物显著影响了抚仙湖浮游细菌群落的变化,分别单独解释了浮游细菌群落结构变化的1.3%、5.3%和14.3%,水温和浮游植物共同解释了12.0%,总磷和浮游植物共同解释了6.0%,水温、总磷和浮游植物三组环境因子共同解释了0.3%。(4)相关分析显示浮游植物优势种转板藻与浮霉菌门Phycisphaera、疣微菌门Limisphaera、疣微菌门Opitutus显著正相关,与放线菌门Ilumatobacter、放线菌门Micropruina、绿弯菌门Bellilinea显著负相关;丝藻与放线菌门Terracoccus、β-变形菌、浮霉菌门Gimesia显著正相关,与放线菌门Ilumatobacter显著负相关;隐球藻与放线菌门Micropruina、β-变形菌、γ-变形菌、浮霉菌门Thermogutta、浮霉菌门Singulisphaera、浮霉菌门Pirellula、浮霉菌门Aquisphaera、厚壁菌门Exiguobacterium显著正相关,与放线菌门unclassified、拟杆菌门Sediminibacterium显著负相关;小环藻与α-变形菌、β-变形菌显著正相关;脆杆藻与放线菌门unclassified、β-变形菌、γ-变形菌、拟杆菌门Sediminibacterium、浮霉菌门Phycisphaera、浮霉菌门Tepidisphaera、绿弯菌门Bellilinea显著正相关;角甲藻与α-变形菌、β-变形菌、拟杆菌门Haliscomenobacter显著正相关,与放线菌门Ilumatobacter、放线菌门Micropruina、拟杆菌门Ornithobacterium、绿弯菌门Bellilinea显著负相关;多甲藻与α-变形菌、γ-变形菌、拟杆菌门Haliscomenobacter、浮霉菌门Thermogutta、浮霉菌门Pirellula、浮霉菌门Aquisphaera显著正相关,与β-变形菌、拟杆菌门Sediminibacterium显著负相关;锥囊藻与放线菌门Terracoccus、α-变形菌、拟杆菌门Pseudarcicella、拟杆菌门Flavobacterium、拟杆菌门Haliscomenobacter、拟杆菌门Mangroviflexus、浮霉菌门Phycisphaera、浮霉菌门Gimesia、疣微菌门Limisphaera、疣微菌门Subdivision3_genera_incertae_sedis显著正相关,与放线菌门Micropruina、γ-变形菌、绿弯菌门Bellilinea显著负相关。