【摘 要】
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阿尔茨海默病（Alzheimer disease,AD）是最常见的神经退行性病变之一,但其病理机制尚不明确,治疗及诊断方法有限。表观遗传调控在AD中变得越来越重要。通过对两种类型的微阵列数据集（基因表达和DNA甲基化）进行联合分析,确定基于甲基化的关键调控基因,能帮助我们更好地理解AD的分子生物学机制。目的:1.通过蛋白组学和DNA甲基化进行联合分析,了解其信息特征;2.确定甲基化和蛋白组学交集的
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阿尔茨海默病（Alzheimer disease,AD）是最常见的神经退行性病变之一,但其病理机制尚不明确,治疗及诊断方法有限。表观遗传调控在AD中变得越来越重要。通过对两种类型的微阵列数据集（基因表达和DNA甲基化）进行联合分析,确定基于甲基化的关键调控基因,能帮助我们更好地理解AD的分子生物学机制。目的:1.通过蛋白组学和DNA甲基化进行联合分析,了解其信息特征;2.确定甲基化和蛋白组学交集的关键调控基因;3.探究关键基因参与的分子生物学机制。方法:从基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）检索并获取蛋白芯片数据集（GSE29676）和DNA甲基化数据集（GSE134379）。首先,我们将AD组与对照组进行比较,利用R（v3.6.1）软件中的“LIMMA”和“CHAMP”软件包筛选差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）和差异甲基化基因（differential methylation genes,DMGs）。然后,我们利用“cluster Profiler R”软件包富集了DEGs和DMGs的重要生物学功能。最后,对DEGs和DMGs进行了综合分析,确定同时表现差异表达和甲基化的关键基因。结果:与对照组相比,我们在AD患者中发现了817个DEGs和746个DMGs。通过综合分析,15个基因同时存在于DMGs和DEGs中,分别为:ABLIM1、ARHGEF7、MPG、RALGDS、TBPL1、WPF1、ZNF207、ARHGAP26、CANT1、CDK6、CTBP1、ESRRA、RNF13、SLC37A1、TBCD。我们认为,这些基因的差异表达更可能归因于甲基化的改变。同时发现,CTBP、ESRRA、RALGDS、TBCD和WPF1的甲基化水平与表达水平呈显著负相关。结论:在这项研究中,我们确定了15个既存在DNA甲基化又存在蛋白芯片数据集的基因,并强调了使用这15个基因作为AD的关键调控基因或药物靶点的分子生物学及临床意义。
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