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本研究对从多种动物分离到的16株H9N2亚型禽流感病毒进行HA、NA、M、NS、NP、PB2、PB1和PA基因的克隆和测序(WB/GX/63/05仅测定HA、NA、M、及NS 4个基因)。结果表明,16株广西毒株HA基因的核苷酸及推导的氨基酸同源性分别为91.4～99.9%和93.6～100%;NA基因的核苷酸及推导的氨基酸同源性分别为90.8～100%和89.9～100%;M基因的核苷酸同源性为92.8～100%,推导的M1及M2蛋白的氨基酸同源性分别为93.3～100%和80.8～99.0%;NS基因的核苷酸同源性为94.0～100%,推导的NS1及NS2蛋白的氨基酸同源性分别为90.5～100%和91.8～99.2%;15株广西毒株NP基因的核苷酸及推导的氨基酸同源性分别为91.6～99.9%和96.4～99.6%;PB2基因的核苷酸及推导的氨基酸同源性分别为85.4～99.9%和94.1～99.9%;PB1基因的核苷酸及推导的氨基酸同源性分别89.0～99.7%和94.1～99.7%;PA基因的核苷酸及推导的氨基酸同源性为88.9～99.8%和94.8～99.5%。对与禽流感病毒致病性及宿主选择性相关氨基酸位点的分析显示广西H9N2亚型毒株在HA裂解位点处存在3种氨基酸排列顺序,分别为PARASR*G、PARSSR*G和PSRSSR*G,均含有两个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒的分子生物学特征。5株广西分离株CK/GX/37/05、DK/GX/51/05、CK/GX/55/05、WB/GX/63/05和WB/GX/Hl/06在HAl蛋白第226位氨基酸位点处由谷氨酰胺(Gln)变为亮氨酸(Leu),具备人类流感病毒的受体特征。HA基因系统进化树分析显示,广西毒株均属于欧亚谱系。除HA、NA和NS基因均属于以CK/BJ/94为代表的BeiJing亚系外,其余基因均具有不同的基因来源。依据进化树所做的基因型分析显示广西毒株经历了广泛的重组而产生了多种基因型。广西毒株分属A、B、C、D、E、F、G和H8个不同的基因型。A、C、D、G及H基因型仅含有1株广西分离株,B和F基因型均含有2株广西分离株。E基因型包含了8株广西毒株,是当前我区流行的主型。基因型的划分具有一定的时间性特征,但不具备明显的宿主及地域性特征。