在经济全球化的大环境下,资本市场的活跃程度一直处于上升趋势,自然人之间、自然人与企业之间股权转让行为成为企业调整经营战略的重要手段,这使得股权转让的征管工作开始受到广大税务机关的重视,同时也成为国内外学者研究和关注的重点。股权转让行为能够促进企业升级和转型,有利于市场资源进行有效配置,其作用在我国“供给侧改革”和提升资源优化配置率的大背景下会变得更加突出。但随之而来的是,企业的股权转让行为变得更加灵活与频繁,股权转让的隐蔽性和零散性等特点带来的弊端开始显现出来,股权价格难以确定、自然人纳税人管理困难等问题给税务机关的征管工作带来了更大的风险和挑战。本文在股权转让和税收风险理论的基础上,分析和研究了当前阶段我国税务机关的股权转让个人所得税征管制度,针对我国现有的股权转让征管相关的规范文件进行了梳理和研究。通过税务机关在征管工作中遇到的案例,较为详细地展示了税务机关在股权转让征管中的包括监管流程、股价认定等环节在内的税务征管制度和征管手段,发现了股权转让的个人所得税征管工作中存在的一些问题。本文采用案例分析的方法对股权转让征管中存在问题加以说明,并指出股权转让个人所得税征管工作中涉及的税收风险。本文根据股权转让征管中存在的风险进一步分析了税收风险的成因,认为股权转让的征管风险在一定的时期内无法完全避免,并提出了应当加大税收风险识别和建立股权转让风险管理体系来应对股权转让征管中存在的风险,进而完善我国股权转让个人所得税征管制度。在借鉴英国和澳大利亚等西方先进国家的征管经验的基础上,本文提出了完善法律法规、建立股权转让风险管理体系、规范评估工作和提升税收执法者工作水平等建议,目的在于有效地降低税务机关涉及的征管风险,解决股权转让税收管理和征收工作中存在的争议和问题,提升我国股权转让个人所得税征管水平。