应用微卫星DNA标记对延边圈养黑熊进行亲子鉴定和遗传多样性研究

来源 :延边大学 | 被引量 : 15次 | 上传用户:laobo999
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黑熊,也称亚洲黑熊,别名狗熊、黑瞎子、月牙熊,是现代生存的陆生食肉目动物中体形最大者。黑熊原来没有被列入保护动物目录,在一些地区还被列为害兽,由于其经济价值和药用价值,经常有人进山猎杀,或捕捉后进行人工繁殖。随着野生种群的不断减少,我国现已将其列为国家二级保护动物,世界各地的学者也都逐渐开展了对熊的研究。随着养殖规模的壮大,为了进一步了解我国存在的黑熊亚种的遗传性状,更好的推动养熊业科学、规范管理,本研究选取19头成年黑熊,通过比较三个不同来源的模板DNA和其浓度对微卫星位点扩增效果的影响,找出适合于微卫星位点扩增的模板DNA浓度,探讨使用毛发作为样本材料进行遗传多样性研究的可行性。利用15对黑熊微卫星标记对延边地区繁殖的圈养黑熊115个个体进行了微卫星多态性测定和统计分析,并对延边地区养殖黑熊进行了亲子鉴定的研究,结果如下:1.毛发根部DNA、血液DNA和组织DNA的PCR产物数量和质量并无明显差异。利用非损伤性采样法,收集100根带有毛囊的毛发可满足微卫星位点扩增模板DNA需求量,50ng/μL的模板DNA浓度为微卫星位点扩增反应的最佳模板浓度,本研究结果进一步证明毛发根部DNA可作为黑熊遗传多样性研究的试验材料。2.本研究从19个微卫星位点中筛选出15个位点进行遗传多样性分析,在黑熊养殖群体中共检测到111个等位基因,每个微卫星位点的等位基因数量为4-11个,平均每个位点7.40个,基因频率分布在0-1之间,说明黑熊养殖群体的遗传多样性比较丰富。3.15个微卫星位点的PIC值在0.4533-0.7422之间,平均值为0.6133,其中只有ABB1、ABB3、ABB7、UT36的PIC值处于0.25与0.5之间,属于中度多态性位点,其余均高于0.5,15个位点平均期望杂合度为0.6213,说明所选标记具有丰富的多态性,能够在分子水平上准确的反映黑熊物种的遗传关系。4.利用15个微卫星标记进行了亲子鉴定研究,分别找出了14头仔熊的亲本父母,亲权鉴定的累积非父排除概率和亲权指数较高,累积非父排除概率达0.999985,亲权相对机会范围是99.9473%-99.9993%。
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