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本研究以辽宁抚顺、吉林桦甸和广东茂名三大典型油页岩矿区为研究对象,采用从油页岩样品中直接提取微生物总DNA,构建细菌16S rDNA克隆文库,并结合荧光原位杂交技术研究油页岩细菌和古细菌的丰度及空间分布,了解我国主要油页岩矿藏中优势微生物群落的结构组成、数量以及空间分布变化。分别采用SDS高盐提取法、SDS液氮研磨法、SDS反复冻融法、SDS异硫氰酸胍法和试剂盒提取法对各矿区微生物总DNA进行提取。结果表明,各方法提取效果差异很大,其中,SDS高盐提取法效果最好,得到约23 kb较完整片段,DNA纯度也满足后继分子操作要求,该法适合油页岩样品。SDS液氮研磨和SDS反复冻融提取法仅能提取到部分样品总DNA,且产率和纯度较低,而SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法则无DNA提出,不适合此类样品。各矿区细菌16S rDNA克隆文库表明,辽宁抚顺、吉林桦甸和广东茂名矿区文库的覆盖率分别55.05%、73.42%、90.12%,三个文库中变形细菌门均为主要类群,在各矿区占有绝对优势。三个矿区共同具有的门类还有拟杆菌门、放线菌门和厚壁菌门；在抚顺矿和茂名矿还存在酸杆菌门和未分类细菌；异常球菌-栖热菌门仅在抚顺矿中发现。各矿区在门的分类层面上,差异较小；在属的分类层面上,差异较明显。各矿区矿层细菌和古细菌FISH检测表明,细菌在各矿区矿层中所占比例均大于50%,古细菌在各矿层中所占比例较低,除在抚顺新鲜油页岩中占4.53%,风化油页岩中占2.25%以外,在其余矿层中所占比例均不足1%。总的来说,三个矿区的细菌多样性差异较大,其中抚顺矿的细菌多样性最为丰富,其次是桦甸矿区,茂名矿区细菌多样性丰富程度最低。古细菌在各矿层中所占比例均是低的。