木薯中性/碱性转化酶基因家族的物理定位

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木薯(Manihot esculenta Crantz)起源于南美洲,是热带地区重要的粮食作物和能源植物。中性/碱性转化酶是木薯淀粉积累过程中的一种关键酶,前人已从木薯中克隆出了中性/碱性转化酶基因家族的11个成员(MeNINV1~10和nINV1),并对其结构进化和表达情况进行了分析。但将它们在染色体上进行物理定位的报道尚少。本研究以木薯华南6号品种的古铜期嫩叶为材料,制备染色体标本,采用荧光原位杂交和原位PCR技术,对木薯中性/碱性转化酶基因家族的10个成员进行了物理定位,明确了它们的分布特点,并阐明了该基因家族与其他功能基因的连锁关系。具体结果如下:(1)对采用木薯华南6号古铜期嫩叶制备染色体标本的方法进行了优化。研究发现:最适的预处理方法是使用饱和对二氯苯溶液处理1.5 h,最适的酶解方案是在5%纤维素酶和4%果胶酶的混合液中37℃条件下酶解4.5 h。(2)对荧光原位杂交过程中的漂洗步骤进行了优化。结果表明,杂交后,3次漂洗的时间分别为5 min、5 min和8 min时,标本背景最干净。(3)利用单色荧光原位杂、双色荧光原位杂交和原位PCR技术,对木薯中性/碱性转化酶基因家族的成员进行了物理定位。结果显示:基因MeNINV5、MeNINV9和MeNINV10均位于第4号染色体上,其中基因MeNINV10位于短臂上,到信号点的百分距离分别为68.52和95.35,基因MeNINV5位于长臂上,到着丝粒的百分距离为22.71;基因MeNINV4和nINV1均位于第6号染色体长臂上,到着丝粒的百分距离分别为43.16和80.71;基因MeMNV6和MeNINV7分别位于第7号和第17号染色体的长臂上,信号点到着丝粒的百分距离分别是15.38和57.97;基因MeNINV2、MeNINV3和MeNINV8分别位于第9号、第5号和第16号染色体的短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离分别是51.88、91.75和76.33。(4)对中性/碱性转化酶基因家族内成员之间的位置关系进行了分析,由于基因MeNINV5、MeNINV9、V10均位于第4号染色体上,因此,这3个基因互为连锁基因;基因MeNINV4和nINV1均位于第6号染色体上,互为连锁基因;其他基因分别位于不同的染色体上,互为独立遗传的基因。(5)讨论了中性/碱性转化酶基因家族的成员与前人已定位的基因之间的位置关系,MeNINV6基因与SBEII和SUT4.1基因均属于第7号染色体上的基因,MeNINV1基因与GBSSII基因均位于11号染色体上;MeNINV2基因与SBEI基因均位于第12号染色体上;MeNINV7基因与SUT2基因均位于第17号染色体上。
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