本研究采用基因克隆、电子克隆、PCR-RFLP三种技术手段,以秦川牛及其与利木赞牛、德国黄牛、红安格斯牛杂交F1代(4月龄)4个牛群体共计164个个体为研究对象,分析了MYOG、MRF4、H-FABP、CAST基因的遗传变异,并以体尺性状作为衡量牛生长发育性状的指标,运用最小二乘线性模型,对所检测到的多态位点与生长发育性状的关系进行了分析,探讨了MYOG、MRF4、H-FABP、CAST基因作为影响牛生长发育候选基因的可能性,克隆了MYOG基因的全序列,电子克隆了MRF4。所得结果如下:1牛MYOG基因的克隆与分析根据GenBank中已公布的人、猪和小鼠的MYOG基因的序列设计了PCR引物,利用PCR技术扩增了牛MYOG基因的全序列,并构建了重组的克隆载体pGEM-T-MYOG。通过PCR扩增、限制性酶切对阳性克隆进行鉴定,并对其进行了测序及生物信息学分析。结果表明,牛MYOG基因的序列长度为3175 bp,其与猪、人和小鼠相应序列的同源性分别为86%,78%和73%,在不同物种之间具有一定的保守性。2牛MRF4基因的电子克隆与分析将牛的MRF4基因的cDNA序列在NCBI数据库进行Blastn分析,得到一个相似性极高的牛的gDNA序列(GenBank:AC138166),通过Blast 2 sequence、Genscan、HMMgene和GENEID程序分析AC138166,推测其中包含的牛的MRF4基因由3个外显子构成。牛MRF4全基因序列与大鼠MRF4基因在1817 bp具有77 %的相似性,与小鼠MRF4基因在1661 bp具有72 %的相似性。分别用Neural Network Promoter和McPromoter prediction程序预测了牛MRF4的5′侧翼序列中可能的启动子。3 MYOG基因启动子PCR-RFLP与牛生长发育性状的相关分析MYOG基因的PCR-RFLP多态性检测结果表明:在秦川牛(Q)及其杂种牛安秦(AQ)、德秦(DQ)、利秦(LQ)群体中,MYOG-HinfI基因座的位点间杂合度(He)分别为0.0431/0.1976/0.0688/0.0814;位点间有效等位基因数(Ne)分别为1.405/1.2463/1.0739/1.8007;位点间多态信息含量(PIC)分别为0.0382/0.1872/0.0664/0.0781。MYOG-SmaI基因座的位点间杂合度(He)分别为0/0.1528/0/0.0416;位点间有效等位基因数(Ne)分别为1/1.1804/1/1.0473;位点间多态信息含量(PIC)分别为0/0.1412/0/0.0407。MYOG-XhoI基因座的位点间杂合度(He)分别为0/0/0/0.0814;位点间有效等位基因数(Ne)分别为1/1/1/1.0866;位点间多态信息含量(PIC)0/0/0/0.0781。利用最小二乘线性模型对MYOG-HinfI基因座的多态位点不同基因型与生长发育性状指标进行显著性检验,结果表明:群体内AA基因型个体在体重、胸围、体长指标上显著高于群体的AB型个体,即AA>AB(P<0.05),存在着A等位基因高于B等位基因的趋势。利用最小二乘线性模型对MYOG- SmaI和MYOG- XhoI基因座的多态位点不同基因型与生长发育性状指标进行显著性检验,结果表明:群体不同基因型在