研究目的：乡镇卫生院作为农村三级医疗卫生服务体系的枢纽,是我国农村医疗卫生服务的主要提供者；办好乡镇卫生院,尤其是贫困地区乡镇卫生院,可以更好地提高农村居民的健康水平与身体素质。本研究通过分析云南省贫困县乡镇卫生院卫生资源配置情况及运行现状,包括房屋建设、配套设施建设、人力资源配置、医疗仪器设备配置、业务开展、运行补偿等方面；以及分析目前制约云南省贫困县乡镇卫生院运行与发展的影响因素,为提高云南省贫困县乡镇卫生院卫生服务提供能力以及改善云南省贫困县乡镇卫生院的卫生资源配置,有针对性地提出政策建议。研究方法：1.利用图书馆和网站资源,通过CNKI数据库、万方资源数据库、维普期刊数据库、PubMed数据库等电子资源查找与乡镇卫生院运行及资源配置有关的文献与政府文件。2.本次调查采取普查的方式,对云南省85个贫困县的975个乡镇卫生院进行调查,调查表由机构负责人或委派机构人员填写。3.应用Excel软件建立数据库,并用spss17.0数据分析包对数据进行整理,主要采用的统计方法有：描述性分析、卡方检验、两独立样本t检验、相关分析及多元线性回归分析。研究结果：1.2014年年末,975所云南省贫困县乡镇卫生院覆盖人口3232.37万人；拥有编制床位28141张,实际开放床位155500张,每千农业人口床位数为6.35张,超出2012年全国平均水平；云南省贫困县乡镇卫生院每千服务人口卫生技术人员数(0.73)、每千服务人口执业医师数(0.11)、每千服务人口助理医师数(0.11)以及每千服务人口注册护士数(0.21)均低于全国平均水平(全国平均水平依次为3.41、1.58、1.40、1.09)。2.中心卫生院在平均服务人口数、基础设施、卫生人员配置、业务用房面积等方面优于一般卫生院,服务能力方面具有显著优势,但在公共卫生服务利用上两类卫生院无差异。3.多元线性回归分析显示：取得医师资格人数、卫生技术人员数、女性节育术例数、剖腹产例数4个因素与医疗收入呈正向相关；高血压患者健康管理人次数、发放避孕药具人次数、本院服务人口数、计生手术后随访人次数、取得全科医生资格数、健康档案建档数、本院服务半径7个因素均与医疗卫生支出呈正向关系。研究结论：1.云南省贫困县乡镇卫生院卫生资源存在浪费与短缺并存的局面。2.云南省贫困县乡镇卫生院房屋及配套设施建设不足；平均危房面积为399.83平方米,远远超过全国水平的82.13平方米。3.云南省贫困县乡镇卫生院卫生人力资源配置不合理,卫生技术人员数量严重不足,且卫生技术人员职称、专业、学历结构不均衡。4.影响云南省贫困县乡镇卫生院医疗收入的四项因素可归类为卫生人力资源配置与卫生服务利用两大方面。影响云南省贫困县乡镇卫生院医疗卫生支出的因素七项因素可归类为医疗卫生服务提供与利用、卫生人力资源配置两大方面。