目的:本研究通过对国内疫情爆发早期较为严重的武汉地区医疗机构进行现状调查,获得武汉市医疗机构药学部在新冠疫情期间的实际应对措施,了解药学部工作人员的应急应对能力现状,发现防疫应对过程中存在的不足,并结合应急管理理论,为疫情防控常态下我国医疗机构药学部应急能力的建设提供有意义的建议。方法:通过文献综述法,搜索、整理、阅读和分析国内外有关新冠肺炎疫情下医疗机构药学部应急应对研究相关的文献,并根据文献研究的结果和2020年国际药学联合会发布的药房应急工作指南设计半结构式的调查问卷,在2020年11月,对武汉市的医疗机构药学部采用配额和滚雪球式抽样方法开展横截面问卷调查获取研究数据,并运用独立样本T检验、单因素方差分析以及Pearson卡方检验等方法,对调查数据进行描述性统计和差异性统计分析。结果:回收预调查问卷14份,正式调查问卷74份。调查对象涵盖了武汉市13个行政区域的39家二、三级医疗机构,共有74位药学部工作人员参与了本次调查。数据分析结果显示:新冠疫情下,95.9%的医疗机构药学部制定了应急工作制度,这些制度包括疫情值班制度（93.0%）、疫情报告制度（90.1%）、应急协调工作制度（84.5%）、应急医疗救治制度（76.1%）、药品检验室工作制度（57.7%）和应急药品供应制度（78.9%）;58.1%的药学部在疫情期间出现了应急药品短缺的问题,除常规采购外（78.4%）,临时采购（86.5%）、政府应急采购（60.8%）等成为疫情下药学部使用较多的应急药品采购方式;81.1%的药学部建立了应急人员动员机制,动员的主要措施为取消员工休假（90.0%）以及科室间的人员调配（73.3%）等,仅有58.1%的医疗机构为紧急调动的人员制定了激励政策,60.8%的药学部将员工的心理干预纳入应急管理机制;97.3%的药学部具有消毒与防护能力,81.1%的药学部成立了专门的工作小组,97.3%的药学部为员工配备了个人防护装备并积极采取其它手段进行疫情防控;48.6%的医疗机构药学部在疫情中开展了静脉用药集中配置服务,35.1%的医疗机构药学部将静脉用药集中调配作为疫情期间的感染防控措施,79.7%的医疗机构药学部在疫情防控过程中利用了信息化手段;开展较多的药学服务为药品的储存与供应（90.5%）、医疗机构感染防护（82.4%）、药品调剂（79.7%）以及捐赠物资管理（70.3%）等,较少在疫情期间开展的药学服务为:药品的研发、自制与生产（21.6%）、患者的心理支持（21.6%）以及学术交流（33.8%）等服务。通过对武汉市不同区域及不同等级的医疗机构药学部进行比较我们发现,中心城区的药学部在医疗机构感染防护和互联网技术的运用方面做的比远城区的药学部好;不同类型医疗机构药学部在静脉用药集中配置服务和临床药学服务的提供能力方面普遍较弱,三级医疗机构略强于二级医疗机构,中心城区略强于远城区。结论:新冠疫情下,武汉市医疗机构药学部在应急制度的制定、感染防控、互联网技术的运用以及传统药学服务等方面普遍表现较好。在具体制度层面,制度建设的全面性、药师的人文关怀、静脉用药集中配置以及临床药学服务等方面仍存在不足。建议武汉市医疗机构药学部将今后应急工作的重点放在缺失制度的补充、药师心理健康监测和奖励机制的完善、静脉用药配置平台的建设和临床药学服务能力的提升等方面。通过全面提升药学部的应急能力更好地应对未来可能面临的新的问题和挑战。