黑曲霉葡萄糖氧化酶基因片段的克隆及序列分析

来源 :大连工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ch12358
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葡萄糖氧化酶(GOD,EC 1.1.3.4)可专一的将p-D-葡萄糖氧化生成葡萄糖酸和过氧化氢,已广泛应用于食品、饲料、医药和生物传感器等行业。现今葡萄糖氧化酶的生产方式主要是Aspergillus niger的工业发酵,但质量及酶活都较低,在分子水平上构建出高产的葡萄糖氧化酶工程菌将对相关应用领域的发展有重要的意义。本实验从大连周边果园土壤中筛选出一株葡萄糖氧化酶产生菌,并对其进行分子鉴定。从该菌株基因组DNA中克隆出GOD基因片段,并对其进行了生物信息学分析。主要结论包括:1.采用碘-淀粉显色法并从大连开发区李家果园土壤中成功筛选出一株产葡萄糖氧化酶菌株。使用五种不同的提取真菌基因组DNA的方法对x-1的基因组DNA进行提取。结合形态学鉴定与ITS序列对比分析判断该菌株为Aspergillus属。2.利用引物设计软件primer premier5.0和Oligo7.0设计引物、确定扩增条件并扩增出一条约1400bp左右的GOD基因序列。将目的片段与pMD20-T载体连接后转入大肠杆菌JM109感受态细胞,通过菌落PCR和双酶切鉴定后,进行测序分析。3.经过NCBI的nucleotide blast结果显示,目的片段插入到了pMD20-T载体中,大小为1444bp,与Akbari Eidgahi M.R.等(2008)发表的Aspergillus niger gox gene for glucose oxidase(X16061)的相似性可达99%。将该克隆的GOD基因片段通过DNAMAN软件分析其氨基酸序列,显示其属于氧化酶超家族且与一株名为Chain A的Aspergillus niger的GOD的氨基酸相似性可达99%。4.对克隆的GOD基因片段进行生物信息学分析,拟表达蛋白的分子式为C2342H3531N641O727S9,分子量为52.587kDa,等电点为4.97.拟表达蛋白为亲水蛋白,没有信号肽和跨膜结构域。二级结构的预测结果显示,克隆序列表达的GOD由27.08%的α-螺旋、15.42%的延伸链和57.50%的无规则卷曲组成。拟表达蛋白质有13个α-螺旋区,无规则卷曲较多。三级结构的预测结果显示,拟表达蛋白有12个α-螺旋及13个β-折叠,这与我们二级结构预测的基本一致。并且含有两个辅基FAD和NAG。说明克隆的GOD基因片段含有可以表达出大部分的主要功能域的序列。
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