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甜瓜(Cucumis melo L.)是一种草本植物,隶属于葫芦科黄瓜属甜瓜亚属。甜瓜果实具有独特的香甜味,深受人民喜爱,现在育种专家们越加的关注甜瓜品质性状并对其进行深入研究。通过开发新的标记,将其用于甜瓜果实品质性状的基因定位,再进一步加密找到与其紧密相连的标记使其应用于甜瓜分子育种,这有助于甜瓜育种进程的加快。因此本试验以厚皮甜瓜MR-1和薄皮甜瓜M1-15为亲本得到170株BC1P1群体,利用基于双亲材料的基因组重测序数据开发的SNP-CAPS标记进行分子图谱的构建和对甜瓜主要果实性状的QTL分析,并根据分析结果,将其相关的标记进行有效性分析。结果如下:基于双亲基因组重测序数据设计578个SNP-CAPS标记,利用双亲及F1代DNA筛选出240个具有多态性的SNP-CAPS标记,多态率41.5%。以含有170株的BC1P1群体为作图群体,利用240个SNP-CAPS标记以及QTLIci Mapping V3.3软件绘制了一张甜瓜分子遗传连锁图谱,其包括12个连锁群(分别对应甜瓜的12条染色体),200个SNP-CAPS标记。其覆盖甜瓜全基因组长度为1710.4c M,平均图距为8.6c M,这12个连锁群长度在111.66c M~183.53c M之间,其中10号连锁群长度是最小(111.66c M);则2号连锁群长度和平均距离是最大的,分别为183.53c M和10.80 c M;8号连锁群平均距离最小(6.63 c M);含标记数目最多的是6号连锁群(20个);10号连锁群则最少(11个)。对甜瓜主要果实性状采取QTL分析,共获得15个QTL位点,分布在1、2、4、5、6、7、8、9和11号连锁群上。其中,与果实长度相关的QTL 4个,其加性效应均为正值,分别位于在第1、5、6和8号连锁群上,总贡献率为46.82%。与果实宽度相关的QTL 1个,在8号连锁群上,贡献率为10.56%,加性效应显示为正值。与果型指数相关的QTL 4个,其加性效应均为正值,在8号连锁群上存在1个主效QTL,贡献率为38.62%,且果实长度、果实宽度和果形指数定位的区域在第8连锁群上是相连的。与单果重相关的QTL 5个,其贡献率均大于15%且加性效应均为负值;与可溶性固形物相关QTL 1个,贡献率大于15%,为主效QTL,加性效应为负值。利用60份甜瓜材料对5个与单果重、果实长度、果实宽度和果型指数相连的标记进行有效性分析,标记M4-2和M11-18对单果重进行分子标记检测,分子数据与田间数据的符合率分别为67%和30%;利用标记M9-9-1对果形指数采取分子检测,分子鉴定和与田间数据的吻合率为48%;标记M8-14和M6-2对果实宽度和果实长度进行分子检测,其结果与田间表型鉴定的符合率分别为62%和63%。