全面推广乡镇国库集中支付制度是乡镇级政府深入国库预算管理改革的一项重要举措，是解决分散账户弊端的资金支付方式。在乡镇国库集中支付制度向基层纵深推进中，不可避免的出现一些普遍性问题。本文选取宁波宁海西店镇乡镇国库集中支付改革的真实案例，以文献阅读法归纳确定了乡镇国库、集中支付制度的概念、以公共财政、公共选择、委托代理等相关理论为指导，详细分析乡镇国库集中支付制度实施背景、过程与效果。针对乡镇国库集中支付制度实施中普遍存在的参与各方思想抵触、审核工作不尽人意、财政资金支付有潜在风险、信息技术运用滞后、业务相关人员综合素质亟待跟进、预算编制起伏大难以精确控制等顽疾，提出通过提高思想认识、健全制度规范、优化管理流程、更新操作系统软硬件配套设施、加强财会人员队伍建设来完善的政策建议。