随着农村适龄儿童的逐渐减少和农民生活水平的逐步提高，广大农民群众对优质教育资源的需求不断增大。农村寄宿制学校的兴建方便了学生上学，便于学校统一管理，促进师生及生生之间的交往，同时也提高了学生的生活自理能力等诸多优点。在此背景下，为了优化农村教育资源，提高农村学校的教育质量和规模效益，促进农村义务教育改革及区域内教育的均衡发展，国家对农村学校进行了新一轮的布局调整。由于农村学校的撤并，寄宿学生大量增多，农村寄宿制学校的建设和特殊困境学生管理成为了教育界和相关民众关注的焦点话题。为了研究农村寄宿制学校特殊困境学生状况，本文选择了河南省信阳市光山县晏河完小为调查研究对象，采用了文献法、访谈法、观察法等方法，通过调查研究发现，农村寄宿制学校普遍存在基础设施不健全、安全隐患大、师资队伍能力有待提高、教师的工作负担和家长的经济负担相应增加、寄宿生心理问题等弊端。笔者通过对晏河完小校长、班主任及特殊困境学生的访谈和实地考察，了解了特殊困境学生群体的基本特点，明确了农村寄宿制学校在管理特殊困境学生中存在的问题，并分析了导致问题产生的因素，提出了合理性的应对策略，以期为农村基础教育的良性发展提供一些参考建议。