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放线菌具有复杂的形态分化过程,拥有产生丰富代谢产物的能力,是一类非常重要的工业微生物。从过去的抗生素筛选到近年来微生物基因组学的研究成果,表明放线菌在天然产物的产生与筛选中都占有极其重要的地位。近年,耐药性的不断增强、顽固疾病及新疾病的不断增多,强烈需要有效新药的问世,这使得科学家们将目光转向一些新型的放线菌资源。动物肠道是一类典型而又独特的环境,过去将肠道可培养放线菌作为资源研究的极少。据查询,国内外对肠道微生物的研究主要集中在人类及畜禽动物,对海洋哺乳动物肠道菌群组成,特别是可培养放线菌多样性的研究则更少。本文通过可培养分析方法,从瘤齿喙鲸肠胃的11个样品中共分离出143株放线菌,分属于放线菌纲的3个目10个科13个属,其中短杆菌属(37.06%)和考克氏菌属(40.56%)为优势菌属。不同培养基分离得到的放线菌株数量和所属种属之间存在明显差异,2216E培养基分离得到72株放线菌,占总分离菌株数量的一半;甘油-天冬酰胺培养基分离得到24株放线菌,分属于8个属。利用Mothur软件将同源性大于97%的菌株划分出了20个OTU,每个OTU单元中挑选一株代表性菌,进行了PKSⅠ、PKSⅡ及NRPS功能基因的筛选及抑菌试验。20株代表性菌株的功能基因扩增结果显示:PKSⅠ、PKSⅡ及NRPS基因覆盖率均为25%。20株代表性菌株对苏云金芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌、大肠杆菌的抑制率分别为100%、55%、10%和5%;对四种真菌即胶孢炭疽菌、棉花枯萎病菌、核盘菌、立枯丝核菌均无抑制作用。另外,本文运用多相分类鉴定的方法,对分别从西太平洋采集的深层海水和沉积物分离得到的菌株GY0594~T和GY0556~T,以及从西南印度洋采集的沉积物样品中分离得到的WP1~T这3个潜在的放线菌新分类单元,进行了分子系统分类、表观特征、生理生化和化学指标等相关的鉴定实验,确定了3株菌株的分类地位。鉴定表明,菌株GY0594~T为类诺卡氏菌属的一个新种,命名为Nocardioides rotundus,典型菌株为GY0594~T(=MCCC 1A10561~T=KCTC 39638~T);菌株GY0556~T为假诺卡氏菌属的一个新种,命名为Pseudonocardia citri sp,典型菌株为GY0556~T(=MCCC 1A10574~T=KCTC 39641~T);菌株WP1~T为拟无枝酸菌属下的一个新种,命名为Amycolatopsis albosporeus,典型菌株为WP1~T(=MCCC 1A10745~T=KCTC39642T~)。