选取几种经典的胡敏酸和富里酸模型，使其与金属离子和西玛嗪分子（有机农药分子）作用，将生成的结合物利用HyperChem软件绘制二维分子结构模型，然后将其进行三维转换和结构优化。据优化过程生成日志文件中的能量值、能量梯度及计算得出QSAR特征参数，从模型之间、模型与单体之间，对计算得到的三维模型性质加以对比和分析得出结论，通过主成分分析方法对上述结论进行验证。结果表明：1从不同的HA与FA模型的疏水性顺序和O／C原子数比值排序对照可知，模拟腐殖酸模型的疏水性与该模型O／C原子数比值成反比，腐殖物质本身具有较强的亲水性（即较低的疏水性），HA模型中的Dragunov—HA和FA模型中的Schnitzer和Khan模型更符合这一点。胡敏酸的Stevenson—HA、Dragunov—HA和富里酸的Alvarez-Puebla模型在水溶液中和高温条件下都能达到更好的稳定性。胡敏酸分子Dragunov—HA和富里酸分子Schnitzer和Khan模型比其它胡敏酸、富里酸分子模型的疏水性强，胡敏酸分子Felbeck—HA和富里酸分子Buffle—FA的折射性、极性比其它胡敏酸、富里酸分子模型强。2在Hyperchem软件操作平台上，对几种胡敏酸、富里酸分子模型与金属离子K⁺、Na⁺、Cu²⁺、Pb²⁺的结合物进行三维模拟。从结合物模型之间、模型与单体之间对比结合物模型的QSAR参数，得出各种模型的特点。综合比较结果表明：Fuchs—HA和Alvarez—FA与金属离子结合物的疏水性小于其他它腐殖酸分子；Felbeck-HA和Buffle—FA与金属离子结合物的折射性、极性、近似表面积、栅格表面积、体积、质量同比小于其它腐殖酸分子。疏水性与折射性、极性、近似表面积、栅格表面、体积、质量在HA和FA与金属离子结合物模型上表现出的不同，应用主成分分析的结果正好验证了上述现象，说明此软件对于腐殖质结构设计具有一定的可信度。因此，我们得出Felbeck-HA和Buffle—FA与金属离子结合物相比其它模型结合物的结构更加合理。3以Hyperchem软件为工具建立胡敏酸、富里酸与西玛嗪分子结合物模型，得出结论为：总的来说，与胡敏酸和富里酸单体相比，结合物的QSAR参数都增加了，其中Fuchs—HA和Alvarez—FA与西玛嗪分子结合物的疏水性、近似表面积同比小于其它结合物，然而，Felbeck-HA和Buffle—FA与西玛嗪分子结合物，在剩下的QSAR参数中，均同比小于结合物。主成分分析将疏水性和近似表面积划分为一组，其它的为另一组，这一分析结论恰好证明上面的性质。