海关对加工贸易的监管是加工贸易健康发展的必要条件,而海关对加工贸易监管的效能在很大程度上取决于海关加工贸易监管制度的完善程度。因此,只有不断完善海关加工贸易监管制度,才能支持和促进我国加工贸易的健康发展。基于以上观点,本文运用制度效率理论对海关加工贸易监管制度进行分析。首先将海关加工贸易监管制度视为制度结构,梳理出构成这个制度结构的备案核销制度、单耗管理制度、保税核查制度、风险担保制度、深加工结转制度、联网监管制度、出口加工区监管制度等七项制度安排,并结合案例查找海关加工贸易监管制度中不利于海关高效监管和企业正常运作的效率欠缺的各种表现(即问题),然后从单耗管理制度安排的普适性,备案核销制度自身及其与保税核查制度、风险担保制度、联网监管制度之间实现功能的完善程度,部分规定不符合加工贸易企业现代运营模式的客观要求,制度结构中存在监管漏洞等制度本身不完善之处进行原因分析,进而从制度制定和执行的理念、执法水平、部门间协作等方面进行深层次的原因剖析,最后结合国家对加工贸易发展的政策导向,提出优化制度的适用范围、消除制度障碍、提高制度结构的耦合度和追求监管的综合效益等提升海关加工贸易监管制度效率的相关对策,力求及时完善现行海关加工贸易监管制度,为加工贸易的健康发展创造良好的制度环境。