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自然界中的微生物与人类的生活息息相关。无论是历史悠久的食醋、酱油、酒精饮料的酿造,还是现代工业中的微生物采矿、环境治理等都与微生物有着紧密的关系。科学技术及医疗诊断的发展使人们认识到,人体内的微生物与个体健康也有着千丝万缕的联系,人体微生态如口腔微生态、肠道微生态的失衡可能导致一系列疾病的发生和发展。人体微生物的群落结构又受到生活环境与生活习惯的影响。生物信息学分析软件 QIIME(Quantitative Insights Into Microbial Ecology)和实时荧光定量核酸扩增检测系统(RT-PCR)是比较成熟的研究微生物群落的工具和方法。本实验基于QIIME和RT-PCR分别对口腔微生物和肠道益生菌做了不同方面的研究,旨在探索饮食习惯与口腔微生物群落结构的关系,了解饮食习惯对人体健康的潜在影响,以及探索肠道益生菌共培养生长的生长特性的研究方法,为之后将共培养范围扩展至全肠道微生物,模拟体内环境进行益生菌互作或肠道微生物互作研究打下基础。主要内容如下:1、通过问卷调查,以大学生群体为研究对象,选取符合实验要求的36名受试者提供唾液样本。提取唾液样本中微生物DNA并用Illumina测序平台测序。使用Linux服务器搭建QIIME分析平台,配置分析环境,使用QIIME软件对测序数据进行一系列生物信息学分析。36名受试者分为荤食组(A组)19人,素食组(B组)17人。在经过生物信息学分析后,得出结论:口腔唾液中Corynebacterium、Streptococcus等潜在致病或条件致病菌的属与常吃荤食呈正相关,而Peptostreptococcus、Eubacterium等无害菌属与常吃荤食呈负相关。实验证明荤素饮食习惯与口腔微生物群落结构存在关联。2、筛选出鼠李糖乳杆菌GG株(Lactobrcillus rhamnosus GG,LGG)、动物双歧杆菌第12号菌株(Bifiobacterium animalis subsp.Lactis Bb-12,BB12)、尼氏大肠杆菌 1917 菌株(Escherchia coli Nissle 1917)共3株益生菌参与益生菌共培养实验,通过对生长标准曲线、生长动力学曲线的分析,确立共培养条件、设计共培养方案,使用麦康凯培养基对共培养体系中Nissle 1917进行筛选培养;以LGG的pheS基因为内参基因,luxS基因为实验基因进行RT-PCR实验。通过对Nissle 1917菌株的共培养筛选实验与LGG菌株的共培养RT-PCCR实验,得出结论:在共培养时,LGG与BB12对Nissls1917的生长均有抑制,当LGG与BB12 一起生长时对Nissle 1917的生长抑制效果更强。在共培养实验时,LGG分别与BB12或Nissle 1917培养时,BB12和Nissle 1917均会对LGG产生生长抑制,而在3种益生菌共培养时,BB12和Nissle 1917对LGG的生长却有促进作用。因此,这3种益生菌共培养过程的互作机制有待进一步研究。