近年来,由于我国经济发展尚处于转型阶段,粗放式的经济发展模式仍普遍存在,不可避免地引起诸多生态环境污染事件,行政手段却难以弥补由生态环境污染带来的经济损失,因此市场化生态污染补偿机制亟待提出。本文从环境经济视角出发,界定了生态污染补偿以及市场化模式的概念,并对有关理论进行提炼和归纳,提出了市场化生态污染补偿标准设计的理论模型。在技术层面上,通过数据信息收集并应用主客观赋权方法设定权重,运用综合评价模型对生态环境污染进行技术等级评定,通过面板回归模型,进行我国工业行业生态污染补偿标准设计的实证研究与太湖流域苏沪边界补偿标准设计的案例研究。研究结论如下：(1)我国七大重污染行业生态环境状况逐年好转,但整体状况仍不容乐观；我国太湖流域苏沪边界水质普遍位于劣五类等级,主要污染物为氨氮；(2)单位生态环境污染综合评价指数会显著造成下风区域(下游流域)受害实体经济损害,市场化生态污染补偿标准和补偿金额可由污染边际成本加以确定。从行业市场化生态污染补偿标准看,受害实体具体的生态污染补偿额从大到小排序依次是设备仪器制造行业、食品加工制造行业、木材家具印刷文教制品行业、工艺品及其他制造行业、烟草制品行业和燃气和水的生产和供应行业；从太湖流域苏沪边界上下游流域污染补偿标准的案例测试看,太湖流域上游江苏省每排放1吨氨氮污染物会造成下游上海市工业企业的经济损害约为27.53万元,进一步推算得到上海市工业企业平均每年因氨氮造成的经济损害约为262.73亿元。