2型糖尿病患者家系外显子测序的分子病因探讨

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[目 的]:探讨家系2型糖尿病的可能致病基因及致病基因的突变位点。[方 法]:收集直系亲属中至少三代人有糖尿病的家系成员7个(其中先证者为第二代中有10年糖尿病病史的男性患者),并采集家系成员的外周静脉血,分离血细胞与血浆。运用全血基因组DNA快速提取试剂盒提取血细胞DNA,然后进行全基因组外显子测序和生物信息数据分析寻找可能的家系致病基因及致病基因的突变位点。[结 果]这一家系成员中,三代直系亲属均有人患糖尿病,糖尿病发病特点符合多基因遗传规律。全基因组外显子测序及生物信息数据分析发现家系成员中6个糖尿病患者均存在外显子DNA的突变8383个,包括单核苷酸多态性(SNP)突变位点7603个,插入缺失(Indel)突变位点780个,1个非糖尿病的对照者未发现外显子DNA的突变。通过对该家系糖尿病特有SNP和Indel位点的显著性分析最终发现显著且具有中高度生物学功能的突变位点22个,其中SNP突变位点10个,Indel突变位点12个。将22个突变位点对应的基因在KEGG通路中定位,最终PNLIPRP1基因和CAMKK2基因定位在KEGG糖脂代谢通路中。先证者的 PNLIPRP1 基因存在一个 rs2305205[c.812C>T(p.Ala271Val)]纯合突变、CAMKK2 基因存在一个 rs778701848[c.1612-1614dupAAA(p.Lys538dup)]纯合突变。先证者父母亲均为杂合突变。PNLIPRP1基因突变可能使其编码的胰腺脂肪酶相关蛋白1与胰腺甘油三酯脂酶(PTL)竞争辅脂酶的作用减弱,导致PTL活性增加,促进脂肪酸消化吸收,增加体脂含量,从而引起胰岛素抵抗。CAMKK2基因突变可能通过抑制下游AMPK通路,导致抗炎和自噬作用减弱、糖脂代谢异常、胰岛β细胞凋亡和胰岛素信号传导通路受阻等,最终引起血糖升高。综上分析提示,PNLIPRP1 基因 rs2305205[c.812C>T(p.Ala271Val)]位点突变和CAMKK2 基因 rs778701848[c.16121614dupAAA(p.Lys538dup)]位点突变可能是这一家系成员糖尿病的致病基因及突变位点。[结 论]本研究通过全基因组外显子测序和生物信息数据分析显示,PNLIPRP1 基因 rs2305205[c.812C>T(p.Ala271Val)]突变和 CAMKK2 基因rs778701848[c.16121614dupAAA(p.Lys538dup)]突变可能是这一家系 2 型糖尿病的致病基因及突变位点。
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