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玉米自交系1145高抗玉米青枯病、甘蔗花叶病毒病、大斑病等玉米生产上的主要病害。以此自交系为材料构建我国玉米的细菌人工染色体文库(BAC)具有重要的意义。本实验用两种限制性内切酶(HindⅢ和BamHI)分别部分酶切玉米自交系1145的基因组DNA,回收100kb以上的酶切片段,分别与pIndigoBAC-5载体进行连接。连接产物通过电击转化导入到大肠杆菌DH10B菌株的感受态细胞中,每次转化获得的BAC克隆数为1,000-3,000个。获得的克隆数总共为221,184个,保存在576块384孔板中。从中随机挑取96个单克隆进行鉴定,结果显示平均插入片段大于100kb,空载率低于3%。按玉米基因组2,500Mb计,构建的1145BAC库约覆盖玉米9倍基因组大小。为了便于采用PCR方法进行BAC文库的筛选,将96个单克隆混成一个BAC亚池,每24个BAC亚池混成一个超级池,最终得到了2,304个亚池和96个超级池。通过碱裂解法提取超级池的BAC质粒用于BAC文库的筛选。
利用发展的玉米抗甘蔗花叶病毒基因Scmv1的基因标签分子标记(引物对为CG2R和CG2F)对BAC库进行了筛选,共得到23个阳性克隆。对阳性克隆的插入片段大小和重叠关系的研究为Scmv1基因的克隆奠定了基础。
玉米抗病自交系1145BAC文库的构建,为玉米基因组物理图谱的构建、基因组的测序、分子标记的发掘、基因的克隆及比较基因组学等研究提供了理想的平台。