杉木[Cunninghamia lanceolata(Lamb.)Hook.]是我国南方山区人工栽培面积最大的速生用材树种。本课题以广西、湖南和贵州等11个地理种源202个杉木无性系为实验材料,测定了树干胸径和木材心边材比、基本密度、结晶度4个性状,分析各性状的遗传变异规律。利用自主开发EST-SSR标记,对种源无性系进行遗传多样性、群体结构及关联分析,寻找与性状相关联的SSR位点。获得的主要研究结果如下:(1)基于近红外测定建立了杉木结晶度预测模型,当光谱区域为4100-6000cm-1,光谱数据进行二阶导数处理,运用偏最小二乘法建立的校正模型预测效果最佳。对未参与建模的已测定样品进行模型评价,相关系数达到0.8751,标准差为0.301,该模型能达到准确预测效果。(2)测定了树干心边材比、基本密度和结晶度共3个材质性状以及胸径指标,不同性状在无性系间差异极显著;对各性状变异系数分析发现,心边材比、胸径、基本密度的变异系数分别为29.54%、18.20%、8.18%,表明研究所选择的杉木群体各材性均具有具有较大的遗传差异。(3)基于EST-SSR分布特征分析,自主开发出42对多态性EST-SSR引物,占总设计引物17.65%。综合主等位基因频率、Shannon’s信息指数及PIC值等指标,发现所选杉木群体具有较高的遗传多样性,群体结构分析可划为3个亚群,研究群体的SSR位点组合D’平均值为0.308,显著性水平P<0.001的条件下有46个位点组合间存在连锁不平衡。通过多态性SSR标记与性状的关联分析,筛选获得12个性状相关联的基因位点,关联标记位点正、负效应等位变异均值存在差异,可以根据育种需求选择适合的位点及相应的等位变异。同一标记位点可以与两个性状关联,等位变异在不同性状上存在不同表型效应的方向和大小。