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目的: 参照朱仁康主编的《中医外科学》里中医辨证分型相关标准对非黑素瘤细胞性皮肤肿瘤(nonmelanoma skin cancer)患者进行中医证型分组,采用常规聚合酶链反应(Polymerase chain reaction)和巢式聚合酶链反应(Nested Polymerase Chain React ion)的方法来检测NMSC患者组织标本中的一类特殊型HPV(EV型),并对扩增产物DNA进行测序,旨在研究NMSC中医证型与HPV感染是否存在相关性。 材料: 标本来源于武汉市第一医院皮肤科门诊,40名患者均经过临床和组织病理确诊为NMSC。其中包括:①新鲜手术组织标本20例:鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma)8例,基底细胞瘤(basal cell carcinoma)12例。手术切下组织后立刻保存于-70℃冰箱。②NMSC石蜡包埋组织标本20例:SCC15例,BCC5例。 方法: 1.分组:参照《中医外科学》里中医辨证分型标准将NMSC患者分成四组,其中疮感风毒型11例、肝火血燥型6例、元气虚弱型15例、肝肾亏损型8例。 2.新鲜手术标本DNA的提取:①每3-5mg组织研磨后加入200ul 1号缓冲液和30ul蛋白酶K(10mg/ml),37℃孵育,24小时后加10mg/l蛋白酶K30ul,继续孵育24小时;95℃水浴加热10min,得到DNA粗提物。②DNA粗提物经过酚、氯仿、异戊醇、异丙醇、乙醇等纯化沉淀洗涤干燥等得到模板DNA。 3.新鲜手术标本的扩增:采用EV型通用引物CP65-CP70(CP65:5′CA(A/G)GGTCA(C/T)AA(C/T)AATGG(C/T)AT3′,CP70:5′AA(C/T)TTTCGTCC(C/T)A(A/G)AG(A/G)A(A/T)ATTG(A/G)TC3′,分别位于HPV-8基因组序列的6832—6851和7273—7298位置)和CP66-CP69(CP66:5′AATCA(A/G)(A/C)TGTTT(A/G)TTAC(A/T)GT3′,CP69:5′G(A/T)TAGATC(A/T)ACAT(C/T)CCA(A/G)AA3′分别位于HPV-8基因组序列的6862-6881和7231-7250位置)对新鲜手术标本进行巢式PCR,扩增HPV DNA。CP65-CP70扩增后得到目的片段为452-467bp的产物;然后用CP66-CP69进行第2步扩增得到目的片段为370bp左右的终产物。 4.石蜡包埋组织标本的DNA提取:①切10um厚石蜡包埋组织标本的切片5片,二甲苯脱蜡、乙醇洗涤,干燥后加TES缓冲液500ul、30ul蛋白酶K(10mg/ml)溶液和30ul 20%的SDS,56℃水浴72h,每24h加入等量蛋白酶K(30ul)一次。95℃水浴加热10min,得到DNA粗提物。②DNA粗提物经过酚、氯仿、异戊醇、异丙醇、乙醇等纯化沉淀洗涤干燥等得到模板DNA。 5.石蜡包埋组织标本的扩增:①用HPV通用引物FAP59/FAP64(FAP59:5,TAAC(T/C)GTIGGICA(C/T)CC(T/C)TATT-3′,FAP64:5,CC(T/C)ATATC(T/C)(A/C/G)(A/C/T)CATITCICCATC 3′)对石蜡包埋组织标本DNA扩增。 6.β-Globinl,β-Globin2参照PCR:β-Globinl and β-Globin2(β-Globinl:5′CAACTTCATCCACGTTCACC3′,β-Globin2:5′GAAGAGCCAAGGACAGGTAC3′)引物作为参照PCR,用于验证DNA模板的质量。 7.对部分扩增产物进行测序,测序结果与GenBank上的已知序列进行对比、分型。