农民工是我国改革开放政策工业化、城镇化进程中出现的一个特殊的劳动群体,为我国的经济建设和社会发展尤其是城市建设和农村的发展做出了巨大贡献。但由于我国长期以来实行的城乡二元经济发展模式,外出农民工实际上既无法享受到户籍地相应的农村社会保障,也进入不了城镇、从业地区的社会保障体系。本文从社会公平和效率兼顾的视角,对我国农民工社会保障制度中存在的问题及其原因进行分析,提出：在以科学发展观为指导思想的和谐社会建设时期,在农民工社会保障制度建设中应以“社会公平优先,兼顾资源使用效率”为基本原则,即在农民工基本社会保障制度设计中注重实现和维护社会公平,坚持农民工基本社会保障的均等化方向,而支持农民工基本社会保障均等化的财政政策应“兼顾资源使用效率”,以“以钱养源”为政策的切入点,提高财政资源的配置效率,以实现效率与公平在农民工社会保障制度建设中的结合,建立适合我国当前社会实际和农民工自身特点的社会保障制度,同时要加强对支撑这种政策实施的配套措施,如财政分权、财政支出、财政转移支付等制度的改革。