植物乳杆菌是发酵食品、人和动物肠道中的常见菌种,对形成食品风味以及维持宿主健康状态具有重要意义。植物乳杆菌快速可靠的种内分型是其应用推广的重要前提,多位点序列分型技术(Multilocus sequencing typing, MLST)是目前强有力的种内分型工具。本研究以分离自泡菜(69株)、发酵乳制品(54株)、酸粥(17株)、酸面团(17株)中的157株植物乳杆菌为研究对象,结合已上传全基因组序列至NCBI公共数据库的7株植物乳杆菌,利用8个看家基因clpX、groEL、murC、murE、 pheS、pyrG、recA和uvrC构建MLST方案对试验菌株的基因多样性进行研究,进而推演菌株问的亲缘关系和进化历程。结果表明：164株菌共分为68个序列型,9个克隆复合体,41株菌(25%)均有自己独特的序列型。此外,本研究通过计算IA、IAs值以及Split decomposition分析得出重组导致了基因多样性的增加。利用Split decomposition和Structure分析预测了164株植物乳杆菌分离株可能起源于5个主要的祖先群体,并推测分离自内蒙古酸面团中的植物乳杆菌分离株更接近最早的祖先群体,经最小生成树关联分析得出大部分菌株的种群结构与样品分离源具有一定的相关性。本研究通过建立植物乳杆菌种内分型体系对不同来源植物乳杆菌的种群结构和进化关系进行研究,从基因水平上为植物乳杆菌的准确鉴定和工业上食品发酵剂的筛选提供参考。