【摘 要】
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球毛壳菌(Chaetomium globosum)属于子囊菌门,可以通过多种作用机制达到杀害植物病原菌的作用,是一种优良的植物病害的广谱生物防治微生物.通过基因本体论(Gene Ontology,GO)
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球毛壳菌(Chaetomium globosum)属于子囊菌门,可以通过多种作用机制达到杀害植物病原菌的作用,是一种优良的植物病害的广谱生物防治微生物.通过基因本体论(Gene Ontology,GO)中的相关的规范术语和BLAST分析结果来对球毛壳菌独立基因进行注释,利用GO的语义模型构建不同物种数据库之间的语义联接,在此基础上建立球毛壳菌EST生物信息分析数据库,在概念和联系层面上有效地解决了不同物种生物信息的整合问题,实现了对球毛壳菌生物信息学数据智能化的多重、复合和交叉检索.通过新构建的基于GO的球毛壳菌EST生物信息学分析数据平台和多种生物信息学分析方法的综合运用,从已知基因中鉴定了几丁质酶Ⅲ基因、β-1,3-葡聚糖酶基因、海藻糖特异性外源凝集素基因、麦角固醇生物合成基因和循环肽HC毒素基因等生物防治相关基因.进一步利用多种生物信息学分析软件和分析系统对生物防治相关基因综合分析,得到了β-1,3-外切葡聚糖酶基因、ESTA00550麦角固醇生物合成相关基因、CONTIG32的假定蛋白基因等球毛壳菌生物防治相关基因的产物蛋白序列、功能预测、亚细胞结构定位和三维结构预测等方面数据,为球毛壳菌生物防治分子机理和代谢途径的研究及生物防治相关基因产物的表达奠定了基础.
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