【摘 要】
:
乳腺癌是全球女性最常见的恶性疾病。随着诊疗手段的不断提高,原发性乳腺癌对患者的生命威胁已得到有效控制,相比之下,乳腺癌发生转移则会导致患者死亡,且成为首要原因。经研究发现,乳腺肿瘤细胞有向特定器官转移的倾向性,肺部是乳腺癌最常见的转移部位之一。我们希望能通过有限的生物标志物来识别具有高度肺转移风险的乳腺癌患者。经过对GEO数据库的全面检索,我们得到了符合研究标准的两个数据集:GSE5327和GSE
论文部分内容阅读
乳腺癌是全球女性最常见的恶性疾病。随着诊疗手段的不断提高,原发性乳腺癌对患者的生命威胁已得到有效控制,相比之下,乳腺癌发生转移则会导致患者死亡,且成为首要原因。经研究发现,乳腺肿瘤细胞有向特定器官转移的倾向性,肺部是乳腺癌最常见的转移部位之一。我们希望能通过有限的生物标志物来识别具有高度肺转移风险的乳腺癌患者。经过对GEO数据库的全面检索,我们得到了符合研究标准的两个数据集:GSE5327和GSE2603。在训练集GSE5327中,我们通过单基因log-rank检验初步筛选出与乳腺癌肺转移相关的基因,并对这些基因进行GO生物功能和KEGG信号通路富集分析。通过一种稳健的基于似然函数的生存分析建模方法,我们确定了用于构建乳腺癌无肺转移生存列线图的最佳基因。在模型构建完成之后,我们在训练集GSE5327和验证集GSE2603中分别对该预测列线图的有效性进行了评估。通过初步的单因素生存分析,共有319个基因被认为与乳腺癌的肺转移有关。同时,这些基因所富集的GO生物功能和KEGG信号通路也得到确认。通过rbsurv算法,我们选择了其中6个最优基因来构建乳腺癌无肺转移生存列线图:GOLGB1,TMEM158,CXCL8,MCM5,HIF1AN和TSPAN31。通过内部数据验证和外部独立数据验证,证实了该预测列线图在预测乳腺癌患者肺转移风险方面的有效性;与此同时,验证了这些基因与乳腺癌的骨转移无关,仅具有肺转移特异性;而且我们还发现,其中5个基因在TIMER数据库中被发现在多种肿瘤中具有异常表达。在本研究中,我们对公共数据库进行数据挖掘,通过生物信息学方法和数学建模构建了一种基于6个基因的乳腺癌无肺转移生存期的预测列线图。该模型可以方便地被应用于临床实践,对临床乳腺癌患者肺转移风险的预测具有实用价值。此外,这6个基因都可以作为潜在的乳腺癌肺转移治疗的生物标志物。同时,这一列线图的构建过程将为其他预测肿瘤向特定器官转移的研究提供良好的参考。
其他文献
采用叶片冲洗液培养法和消毒叶片研磨液培养法,从郑州郊区温室及露地黄瓜叶片上分离得到45株放线菌。采用室内平板对峙法测定了各菌株对黄瓜灰霉病菌的抑菌作用,初筛出抑菌效果
海苔是以干紫菜为主要原料,添加或不添加食品添加剂等其他原料,经烘烤等工艺制成的、可直接食用的食品。丰富的营养和好吃的味道让海苔收获了大批吃货的心,但高盐等健康隐患也让一些人望而却步。那么,究竟该如何健康吃海苔呢?注意钠和碘的摄入量 1克盐含393毫克钠,1~3岁儿童每天需要700毫克钠(相当于1.8克盐),4~6岁儿童每天钠摄入不宜超过1200毫克(相当于3克盐),成人每天钠摄入量不超过2000
将溶胶-凝胶法与水热法相结合制备活性碳纤维(ACF)-Ag-TiO2纳米纤维复合材料,利用扫描电镜、透射电镜、能量色散型X射线光谱仪对ACF-Ag-TiO2纳米纤维复合物的表面形貌及晶型
“数字化”开启了信息时代信息资源开发利用的新模式、新技术、新方法,但在发展面前,信息安全的重要性也需要被牢记。$$近期,黑市上出现一份数据,称是“趣店学生用户数据”。该数
19世纪后半期至十月革命结束,沙皇俄国经历了一段改革与专制交织、发展与桎梏并行的复杂时期,但正是这一时期,松动的社会结构和机制为商业报刊的产生和发展提供了一定的空间:
近日,一项刊登在国际杂志《BMC Medicine》上的研究报告显示,每天摄入至少20克坚果能够降低个体患心脏病、癌症和其他疾病的风险。研究者对当前很多研究坚果摄入和疾病风险之
<正>2月18日,上海宝冶承建的山钢集团日照钢铁集团有限公司一期二部炼钢3号连铸机工程热负荷试车成功,顺利完成业主要求进度目标。山钢集团一期二部炼钢3号连铸机位于炼钢主
长期伏案、久坐不动、缺乏锻炼,颈椎很容易疲劳过度,导致颈椎病患者越来越多。 颈椎病是西医的病名,中医中并无此病。中医对于颈椎病的认识,主要是根据其发作时的临床表现,将各种症状进行辨证分型,归属于痹症、痿症、眩晕等范畴。对于其发病原因,较为经典的描述是“骨错缝,筋出槽”。中医认为,颈椎病多因外感风寒湿邪伤及经络,或长期劳损、肝肾亏虚、痰淤交阻、气滞血淤所致。 无论何种原因引发的颈椎病,都与“筋”