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中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)产于我国北纬24°以北的沿岸水域，是我国名贵水产品，近年来已发展成我国主要养殖蟹类。养殖中发现，不同水系的蟹苗，生长发育速度不同，成体大小悬殊，人工养殖经济效益差别很大。长江水系的中华绒螯蟹生长快，个体大，品质佳，经济效益好。养殖业的需求，使其它水系的蟹苗大量地引入长江流域，给河蟹养殖业带来严重影响。目前长江天然蟹苗资源已近于枯竭，其它水系蟹苗的引入更导致河蟹种源的混杂。因此，中华绒螯蟹种群的准确鉴定是一亟待解决的问题。不同水系河蟹仅用形态学方法鉴别十分困难。本文用RAPD技术分析了中华绒螯蟹的遗传变异，对辽河种群、长江种群和瓯江种群进行了分子遗传标记鉴别研究，并对得到的种群间多态片段进行了克隆和测序。 RAPD遗传标记鉴别研究对200个随机引物进行了筛选，其中引物HX01和HX02检测到瓯江种群和辽河种群所有样品共有的HX01-400和HX02-700扩增片段，分子量分别为400bp和700bp，这两个扩增片段在模板DNA、镁离子或引物浓度有一定范围内的波动时仍稳定出现，而长江种群样品的PCR反应无这两个扩增片段出现，因而可作为长江种群的鉴别标记。运用上述标记发现人工养殖的河蟹，包括一些苗种场种质十分混杂。本文未发现可以区分瓯江种群和辽河种群的标记。 用31个可重复性好的随机引物对中华绒螯蟹的辽河、瓯江和长江种群进行了RAPD分析。121个扩增片段中有27个多态片段。遗传距离指数(D)表明中华绒螯蟹种内遗传变异较低(D=0.004-0.063)。3个种群中，辽河种群(D=0.018)和瓯江种群(D=0.025)遗传变异较高，而长江种群遗传变异较低(D=0.013)；辽河种群和瓯江种群间遗传距离(D=0.023)小于它们与长江种群间的遗传距离(D值分别为0.028和0.032)。遗传变异方差分析表明中华绒螯蟹种群存在遗传分化(Φst=0.258，P＜0.001)。这种分化主要是不同水系间的分化(Φct=0.235，P＜0.001)，而同一水系不同采样点间遗传分化不显著(Φsc=0.030，P=0.2376)。种群间成对比较分析表明，长江种群与其它种群分化较大，辽河种群与瓯江种群间无显著遗传分化。这提示人类经济活动可能已使后两个种群间发生了基因交流。