自从改革开放以来，特别是2001年我国加入WTO以来，我国引进外商直接投资的速度越来越快，FDI存量越来越大。单纯引进FDI已经不能满足我国对外资的需求。在引进FDI资本时，要看到FDI资本的技术效应对我国创新能力的影响，把FDI看成获得先进技术与管理制度的渠道。至于FDI的技术外溢是否依赖于金融市场的发展程度，研究FDI、金融发展对我国企业自主创新能力的影响，这对我国进一步引进外资、完善和充分利用外资，促进金融市场深化发展有着重要的指导意义。文章解析了FDI发展理论和金融市场发展理论，并运用静态面板模型和动态面板模型相互结合模式，试图解释以下问题：一是FDI、金融市场发展及两者的交叉项是如何影响我国自主创新能力，以及影响的途径或方式？二是从实证上检验分析全国和三大区域FDI、金融发展对我国创新能力的实际影响效果；三是检验各省市的FDI、金融市场发展成对区域自主创新能力的影响？计算金融发展对FDI技术创新溢出的门槛值，检验各省市是否跨过这一门槛值？文章通过分析FDI相关理论，解析FDI对我国企业创新能力的技术溢出影响。主要有两个方面：一是正面促进作用，外商直接投资主要通过竞争关系、模仿效应、关联影响、培训途径以及正反馈机制五种途径促进我国企业自主创新水平的提高；二是消极抑制作用，外商直接投资通过技术内部转移、滞后效应、FDI企业实施研发分工、控制核心技术向我国转移等途径阻碍FDI的溢出效应。本文还分析了E.S.肖和罗纳德·麦金农的金融发展理论，理顺金融市场发展程度对自主创新的作用途径，金融市场的发展如何影响FDI引进的渠道和FDI溢出的传导机制。金融企业通过提供筹资便利、优化经营活动、提供信息咨询、规避经营风险等服务为引进FDI提供便利。通过技术创新（示范效应、竞争效应和产业关联效应）、技术积累（人力资本积累、企业R&D投入）影响FDI溢出的传导机制。因此，东道国获得技术创新和技术积累，从而实现创新活动的发展和创新水平的提高。实证检验外商直接投资、金融发展、自主创新之间的关系，文章采用1997年-2010年全国30个省市区的数据，根据金融市场发展的不同阶段，通过静态模型GLS和动态模型GMM，从全国、区域及省际层面上进行数据回归。得出结论：从全国范围来看，FDI显著地提升了我国的自主创新水平，金融市场发展程度则阻碍了我国创新能力的发展。从三大区域的角度看，FDI促进了三大区域创新能力的发展。金融市场发展水平的提升促进了东部区域的FDI技术外溢，中西部地区由于金融市场效率低下，对区域创新能力的影响表现为负向的阻碍作用。至于省际层面上，截止到2010年，共有北京、天津、上海、浙江、江苏、广东、山东、重庆8个省市跨过了引发FDI正向技术创新溢出效应的金融发展程度的门槛。最后，本文结合理论阐述和实证检验的结果，提出了相关的政策建议，要大力发展资本市场，完善金融产品，为高科技中小企业提供融资；提高金融机构的风险控制水平，发展第三方担保贷款，增加对创新活动的支持和融资服务；完善金融市场体系，提高金融市场的效率；同时继续发展东部区域，深化改革，加大中西部地区政策扶持力度，加快中西部地区建设，实施中西部人才培养计划，从而促进中西部的创新水平提高。