背景和目的：电压依赖性钙通道是中枢神经系统中重要的离子通道,参与癫痫的发生,并且是许多抗癫痫药物的作用靶点之一,钙离子通道改变可能与癫痫耐药密切相关。但目前国内外尚未见钙通道基因与耐药性癫痫的相关报道。本研究拟探讨钙离子通道基因CACNA1A、 CACNA1C、CACNA1H单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms SNP)与中国汉族人群耐药性癫痫的相关性。方法：收集癫痫病人病历资料及外周血标本480例,其中抗癫痫药物(antiepileptic drugs AEDs)敏感组273例,耐药组207例。应用酚氯仿法提取全基因组DNA。通过HapMap、GVS (Genome Variation Server)、 NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库及haploview软件(定义MAF≥0.1r2≥0.8)共筛选出19个tagSNP。采用Illumina定制芯片(Goden Gate)对CACNA1A、CACNA1C、CACNA1H基因共19个候选SNP位点进行基因型鉴定。应用SPSS20.0统计软件分析基因型及相关临床资料；应用SHEsis软件进行连锁不平衡分析。结果：共检测了CACNA1A、CACNA1C、CACNA1H基因的19个候选SNP位点,其中CACNA1C的rs12813888位点因染色体结构性变异导致聚类不好不适于本基因芯片检测方法。1.所研究的18个SNP位点多态性分布在癫痫患者人群中均符合Hardy-Weinberg平衡。2.耐药组与敏感组之间相比,CACNA1A基因的7个SNP位点的基因型分布无显著性差异(P>0.05)3.耐药组与敏感组相比,CACNA1C基因的5个SNP位点的基因型分布无显著性差异(P>0.05)4.耐药组与耐药组相比,CACNA1H基因的6个SNP位点的基因型分布无显著性差异(P>0.05)5.本研究中癫痫患者CACNA1H基因的rs11640354与rs9922076位点之间存在连锁不平衡(D’=0.79)结论：1.CACNA1A、CACNA1C、CACNA1H基因的18个SNP位点的多态性可能与中国汉族人群耐药性癫痫无关2.中国汉族癫痫人群CACNA1H基因SNP位点rs11640354与rs9922076之间存在连锁不平衡