科学技术是第一生产力，是促进经济增长、增强国家竞争力的关键因素，而R&D活动是保证科技发展的必要条件。世界各国都十分重视R&D资源的投入及管理。近年来在科技兴国战略的指导下，我国各级政府也高度重视发展科学技术，科技投入规模不断扩大。因此，对R&D投入产出的效率的研究将有利于我国正确看待资源及科学合理地改善资源配置，极具强烈的现实意义。　　 本文遵循由基础到理论再到应用的研究思路，将内容大致分为基础理论、模型构建和实证研究三部分。本文首先对相关理论研究做了一个梳理，并明确界定R&D活动及其投入产出效率。通过效率评价方法的比较，提出选用数据包络分析(DEA)方法评价R＆D效率，为本文的研究打下理论基础。其次，在指出评估体系构建的指导思想和基本原则的基础上，具体选择了四个投入指标和四个产出指标构成R&D投入产出指标体系。再次是对DEA模型的介绍，重点介绍本文中将要用到的DEA模型-c2R模型及其延伸B2C模型，并运用该模型对山东省及其它省份的R&D效率做实证分析。分析结果表明，山东省的R&D效率处于非最佳状态，存在投入冗余及产出不足等问题，并通过进一步分析得出山东省R&D无效率的主要原因是R＆D投入结构不合理及高技术产业产值不足。最后针对如何合理调整R&D投入结构及提高高技术产业产值做出相关政策建议，具有一定的现实指导意义。