自由贸易试验区发展战略是新时代实施新一轮对外开放的重要举措,随着全面深化改革,自贸区的建设和发展取得长足进步,已经从最初的“一枝独秀”发展到了今天“齐头并进”的新局面。创新驱动发展战略下,自贸区的发展依靠创新推动经济发展、产业进步,而创新离不开知识产权的保驾护航。因此我国自贸区的建设与发展应以构建完善的知识产权保护机制为着力点,为自贸区制度创新、产业升级创造良好的政策氛围。一直以来,我国知识产权保护实行具有中国特色的“双轨制”模式,知识产权行政保护是其中的重要组成部分。行政保护凭借其便捷、高效、保护面广等诸多优点,在知识产权保护体系中一直具有不可替代的作用。近年来,自贸区作为对外开放的重要窗口,对外贸易量不断增加,知识产权侵权问题也随之激增,行政保护随着行政介入侵权案件的增多,呈现出的问题也越来越多,尤其在自贸区这一改革试验田,这些问题表现得尤为突出。为了促进自贸区能够健康稳定发展,我们必须在不断创新发展的基础上,探索构建有效的知识产权行政保护的优化途径,着力提高自贸区行政保护水平和效果。本文以自贸区知识产权的行政保护为研究对象,通过理论分析与实地调研相结合,对比国内外实践经验的方法,努力探索自贸区行政保护体系的有效优化途径。首先,本文对自贸区知识产权保护现状进行分析,从理论的角度,对行政保护的必要性以及自贸区知识产权行政保护的基本概况做了梳理和归纳总结,从实践的角度,针对企业对四川自贸区知识产权行政保护现状的认知情况以及整体满意度做了问卷调查分析。其次,结合理论分析和实地调研,对自贸区知识产权行政保护的问题及成因进行分析,总结出主要存在有政策缺失、社会保护意识淡薄、行政执法问题突出以及保护机制运行不佳四个方面的问题。最后,在借鉴以美国和日本为代表的国外成功经验的基础上,结合自贸区的实际情况提出了构建自贸区知识产权行政保护优化路径的对策建议。