肺腺癌的环状RNA差异表达谱分析及一种新的潜在诊断分子鉴定

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目的通过对肺腺癌组织的环状RNA(circ RNA)差异表达谱分析,寻找新的潜在的诊断分子。方法通过微阵列技术分析4对肺腺癌及癌旁组织,对获得的circ RNA差异表达谱进行初步分析并筛选出差异显著的目标circ RNA。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术进一步在26对样本中验证目标circ RNA的表达,统计分析目标circ RNA的表达水平与临床病理参数的相关性,应用受试者工作特征曲线(ROC曲线)判断其诊断价值。并进一步通过对目标circ RNA的circ RNA-mi RNA-m RNA互作分析及靶基因的GO和KEGG分析,推测目标circ RNA在肺腺癌中的可能作用。结果我们发现了168个差异表达的circ RNA,其中127个为上调的circ RNA,41个为下调的circ RNA。经过进一步分析筛选出差异表达显著的hsacirc RNA000121,且在26对样本中验证的结果与芯片结果是一致的,即肺腺癌组织中的表达量显著高于癌旁组织。统计学分析发现hsacirc RNA000121表达水平与年龄、性别、肿瘤直径大小无关,与淋巴结转移及TNM分期有关,其ROC曲线面积为0.712。生物信息学分析发现hsacirc RNA000121下游靶基因与蛋白多糖代谢、细胞皮质、组蛋白去乙酰酶复合、蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性等基础生物过程相关,与Rap1信号通路密切相关。结论Circ RNA在肺腺癌及癌旁组织中差异表达,其中差异显著的hsacirc RNA000121在肺腺癌组织中高表达,且hsacirc RNA000121的表达量可能与肺腺癌的侵袭性有关。hsacirc RNA000121可能成为检测肺腺癌新的潜在的生物标记物。
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